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创建/更新时间

2026-10-21

资源简介

乳腺癌幸存者接受点阵CO2激光治疗的阴道与尿液微生物群

PRJNA1433238 数据集聚焦于乳腺癌生存者接受点阵CO2激光治疗期间的阴道与尿液微生物群变化。该研究为一项前瞻性纵向研究，旨在检验点阵CO2激光疗法对乳腺癌生存者绝经泌尿生殖综合征的治疗效果。研究对象为26名曾接受乳腺癌激素治疗、随后出现绝经泌尿生殖综合征的女性，她们均接受了五次点阵CO2阴道激光治疗。在治疗前及最后一次治疗结束后，分别采集阴道和尿液样本。微生物组成通过纳米孔测序技术对16S rRNA基因V1至V8区域进行评价，并分析alpha多样性和beta多样性的时间变化。该数据集属于肿瘤/乳腺癌分类，主题标签为原始序列读长（Raw sequence reads），来源站为ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

该数据集来源于一项针对乳腺癌生存者健康问题的前瞻性纵向研究。乳腺癌患者在接受激素治疗后，常出现绝经泌尿生殖综合征，表现为阴道和泌尿系统相关症状。点阵CO2激光疗法被用于治疗此类症状，但其对阴道和尿液微生物群的影响尚需通过纵向采样和测序分析加以评估。该研究纳入26名符合特定条件的女性，即曾接受乳腺癌激素治疗并出现绝经泌尿生殖综合征，随后接受五次点阵CO2阴道激光治疗。研究设计为在治疗前和最后一次治疗结束后两个时间点采集阴道和尿液样本，以观察微生物组成的变化。这一背景使得该数据集对于理解乳腺癌生存者治疗后微生态动态具有潜在价值。

【数据内容】

该数据集包含的原始序列读长来自阴道和尿液样本的16S rRNA基因测序。具体而言，采用纳米孔测序技术对16S rRNA基因的V1至V8区域进行测序。样本采集时间点包括治疗前和最后一次治疗结束后。研究还涉及对alpha多样性和beta多样性的时间变化进行分析。主题标签为“Raw sequence reads”，表明数据集主要提供原始测序读长。关于样本的具体数量、测序深度、数据量大小、文件格式等详细信息，源站未提供。

【采集与来源】

样本采集自26名曾接受乳腺癌激素治疗并出现绝经泌尿生殖综合征的女性。这些女性均接受了五次点阵CO2阴道激光治疗。阴道和尿液样本分别在治疗前和最后一次治疗结束后采集。微生物组成评价采用纳米孔测序技术，针对16S rRNA基因V1至V8区域。数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov。关于采集的具体地点、时间跨度、伦理审批信息、样本处理流程等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究乳腺癌生存者接受点阵CO2激光治疗后阴道和尿液微生物群的变化。潜在应用包括分析治疗前后微生物alpha多样性和beta多样性的时间动态，探索绝经泌尿生殖综合征相关微生态特征，以及为后续临床或基础研究提供原始序列数据。由于涉及肿瘤/乳腺癌分类，也可用于与乳腺癌治疗相关的微生态研究。但具体适用场景需结合源站描述和数据本身进一步确定，源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

该数据集提供原始序列读长，用户可根据研究目的进行微生物组成分析。典型分析可能包括对16S rRNA基因V1至V8区域序列进行预处理、分类学注释、多样性计算等。由于数据来自纳米孔测序，分析时需考虑该平台产生的读长特征。研究设计包含治疗前和治疗后两个时间点，因此可进行纵向比较。关于具体的数据下载方式、分析工具推荐、预处理步骤等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于26名女性的样本，样本量有限。研究仅涉及治疗前和最后一次治疗后两个时间点，时间分辨率有限。测序区域为16S rRNA基因V1至V8，采用纳米孔测序，可能具有特定的错误率或读长偏差。关于数据质量评估、对照设置、批次效应、缺失数据等信息，源站未提供。此外，该研究针对特定人群（乳腺癌生存者接受激素治疗并出现绝经泌尿生殖综合征），结果外推需谨慎。源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、许可协议、使用限制、访问权限等，源站未提供。用户在使用时应参考源站的相关规定。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1433238

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1433238

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这项前瞻性纵向研究的目标是检验点阵CO2激光疗法对乳腺癌幸存者更年期泌尿生殖综合征的治疗效果。26名曾接受乳腺癌激素治疗并随后出现更年期泌尿生殖综合征的女性，接受了五次点阵CO2阴道激光治疗。在治疗前和最后一次治疗结束后，收集了阴道和尿液样本。通过16S rRNA基因V1至V8区域的Nanopore测序评估微生物组成，并分析α和β多样性的时间变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别