PRJNA1428295:炎性乳腺癌中CCR7免疫细胞受体表达

该数据集来自 NCBI,围绕炎性乳腺癌(IBC)中 CCR7 免疫细胞受体表达,对产后小鼠接种 IBC(SUM149)异种移植瘤后开展 RNA 测序(RNA-seq)

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基因组回归Raw sequence reads
PRJNA1428295: CCR7 Immune Cell Receptor Expression in Inflammatory Breast Cancer

基本信息

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任务类型
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创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

PRJNA1428295:炎性乳腺癌中CCR7免疫细胞受体表达

PRJNA1428295 是一个来自 NCBI 的肿瘤/乳腺癌领域数据集,全称为 CCR7 Immune Cell Receptor Expression in Inflammatory Breast Cancer。该数据集围绕炎性乳腺癌(IBC)中 CCR7 免疫细胞受体的表达展开,研究对象为产后小鼠,在其接种 IBC(SUM149)异种移植瘤后开展 RNA 测序(RNA-seq)。实验设计涉及高脂饮食与正常低脂饮食的对比,以及正常时长哺乳与强制断奶哺乳的对比。数据集的主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),可为研究炎性乳腺癌中 CCR7 免疫细胞受体表达及相关饮食、哺乳因素影响提供转录组层面的原始测序数据。

【数据集背景】

炎性乳腺癌(IBC)是一种具有高度侵袭性的乳腺癌类型。该数据集聚焦于 IBC 中 CCR7 免疫细胞受体的表达情况。为在受控实验条件下研究这一问题,研究采用产后小鼠作为实验动物,并接种 IBC 细胞系 SUM149 的异种移植瘤。实验同时设置了饮食与哺乳两个变量维度:饮食方面比较高脂饮食与正常、低脂饮食;哺乳方面比较正常时长哺乳与强制断奶哺乳。通过 RNA 测序(RNA-seq)获取转录组数据,以观察在上述不同条件下 CCR7 免疫细胞受体表达的变化。该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,所属分类为肿瘤 / 乳腺癌。

【数据内容】

该数据集的内容为 RNA 测序(RNA-seq)产生的原始序列读段(Raw sequence reads)。测序对象为接种 IBC(SUM149)异种移植瘤的产后小鼠。实验条件涵盖高脂饮食与正常、低脂饮食的对比,以及正常时长哺乳与强制断奶哺乳的对比。数据集主题标签为 Raw sequence reads,表明其提供的是测序原始读段层面的数据。关于样本数量、测序深度、读长、文件大小、数据格式等具体指标,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。其产生方式为:对产后小鼠接种 IBC(SUM149)异种移植瘤,并在高脂饮食与正常、低脂饮食条件下,以及正常时长哺乳与强制断奶哺乳条件下,开展 RNA 测序(RNA-seq)。数据集英文名称为 PRJNA1428295: CCR7 Immune Cell Receptor Expression in Inflammatory Breast Cancer。关于具体的采集时间、采集地点、实验操作流程、测序平台与试剂等详细信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于炎性乳腺癌(IBC)相关研究,尤其是围绕 CCR7 免疫细胞受体表达的分析。由于实验设计包含高脂饮食与正常、低脂饮食的对比,以及正常时长哺乳与强制断奶哺乳的对比,该数据集可用于探索饮食因素与哺乳因素对 IBC 异种移植瘤模型中 CCR7 免疫细胞受体表达的影响。同时,作为 RNA 测序原始序列读段数据,其可用于转录组层面的基因表达分析、差异表达分析等通用用途。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以原始序列读段(Raw sequence reads)形式提供,通常可用于 RNA-seq 数据的下游分析流程。关于该数据集的具体使用步骤、推荐分析工具、参考基因组版本、数据处理参数等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的主题标签为原始序列读段,属于 RNA 测序的原始数据层面。关于数据质量评分、测序错误率、覆盖度、批次效应、样本量是否充足等质量相关信息,源站未提供。关于该数据集在实验设计、模型代表性、结果外推性等方面的限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),英文名称为 PRJNA1428295: CCR7 Immune Cell Receptor Expression in Inflammatory Breast Cancer。关于该数据集的具体引用方式、许可条款、使用限制等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1428295

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对产后小鼠进行了RNA测序(RNA-seq),这些小鼠在高脂饮食与正常低脂饮食、以及正常哺乳期与强制断奶哺乳的情况下接种了IBC(SUM149)异种移植瘤。

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