PRJNA1419445:万古霉素改善乳腺癌抗肿瘤免疫
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1419445),主题为万古霉素改善乳腺癌抗肿瘤免疫,属于肿瘤/乳腺癌方向

基本信息
资源简介
PRJNA1419445:万古霉素改善乳腺癌抗肿瘤免疫
PRJNA1419445 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学项目数据集,其英文名称为“Vancomycin improves anti-tumor immunity in breast cancer”,中文可理解为“万古霉素改善乳腺癌抗肿瘤免疫”。从名称与分类来看,该数据集聚焦于肿瘤学中的乳腺癌方向,探讨万古霉素与抗肿瘤免疫之间的关系。该项目的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其数据内容以原始测序读段为主。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 体系下的一个项目记录。BioProject 作为生物数据的集合,通常围绕某一项研究计划组织,便于用户集中查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集在站内被归入肿瘤/乳腺癌分类,短描述也指出其主题为万古霉素改善乳腺癌抗肿瘤免疫,整体上是一个与乳腺癌免疫治疗研究相关的测序项目资源。
【数据集背景】
该数据集对应的 BioProject 编号为 1419445,英文名称为“Vancomycin improves anti-tumor immunity in breast cancer”。从标题可以看出,该项目关注的是万古霉素在乳腺癌抗肿瘤免疫中的作用。乳腺癌是肿瘤学中的重要研究方向,而抗肿瘤免疫则涉及机体免疫系统对肿瘤细胞的识别与清除。将万古霉素与抗肿瘤免疫联系起来,提示该项目可能围绕微生物群、抗生素干预与免疫治疗响应之间的相互作用展开。不过,关于该研究的具体假设、实验设计、样本类型、干预方式及研究结论,源站未提供。该数据集在 NCBI BioProject 中的记录,为用户提供了一个集中入口,以便查找与该项目相关的各类生物数据。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其数据内容以原始测序读段为主。原始测序读段通常来自高通量测序平台,是后续数据分析的基础。根据 BioProject 的一般定义,一个 BioProject 记录会汇集与单一研究计划相关的多种数据类型,并提供链接以便用户找到该项目生成的不同数据。因此,该数据集可能包含与乳腺癌抗肿瘤免疫研究相关的测序数据,但具体涉及哪些样本、采用何种测序策略、数据量大小、读长、平台信息以及是否包含其他类型数据,源站未提供。该数据集的分类为肿瘤/乳腺癌,主题标签为原始测序读段,这些信息共同表明其数据内容与乳腺癌研究中的测序工作有关。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一个项目记录。BioProject 是由单一组织或联盟发起的、与某一研究计划相关的生物数据集合。该项目的英文名称和编号明确指向“万古霉素改善乳腺癌抗肿瘤免疫”这一主题。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、研究者所属机构、资助来源以及具体的实验操作流程,源站未提供。该数据集在站内被归入肿瘤/乳腺癌分类,并带有“Raw sequence reads”主题标签,这些信息来自 NCBI BioProject 的记录页面。
【适用场景】
该数据集适用于与乳腺癌抗肿瘤免疫相关的研究场景,尤其是涉及万古霉素干预、微生物群与免疫治疗交互作用的探索。由于主题标签为“Raw sequence reads”,该数据集可用于需要原始测序读段的生物信息学分析,例如序列比对、表达分析、微生物组成分析或其他基于测序数据的下游研究。对于关注肿瘤/乳腺癌方向的研究人员,该数据集可作为查找相关测序数据的入口。此外,由于 BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的多种数据类型,该数据集也可用于了解该项目所生成数据的整体组织方式。但具体适用场景需结合项目实际数据内容判断,源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该数据集,依据项目编号 1419445 或英文名称进行检索。BioProject 记录通常提供链接,指向该项目生成的不同数据类型,用户可据此获取原始测序读段及其他相关数据。使用原始测序读段时,一般需要根据具体研究目的进行质量控制、比对、组装或定量分析等处理。由于该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,使用者应具备处理原始测序数据的基本能力。关于数据下载方式、文件格式、数据量、是否提供预处理数据以及具体的分析建议,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共生物数据资源。BioProject 作为数据集合,提供了查找项目相关数据的统一入口。然而,关于该数据集的具体质量指标,如测序深度、覆盖度、重复性、样本量、数据完整性以及是否存在批次效应等,源站未提供。该数据集的分类为肿瘤/乳腺癌,主题标签为“Raw sequence reads”,但原始测序读段通常需要经过处理才能用于特定分析。此外,该项目的具体研究结论、统计方法及验证实验,源站未提供。因此,在使用该数据集时,用户应结合自身研究需求评估其适用性,并注意源站未提供相关质量与限制信息。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject,编号为 1419445,英文名称为“Vancomycin improves anti-tumor immunity in breast cancer”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等信息,源站未提供。用户在使用该数据集时,应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关政策,并参考源站页面获取最新信息。由于源站未提供具体的引用与许可说明,建议用户直接访问 NCBI BioProject 记录页面以获取权威信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1419445
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
肠道微生物组的调控能够改变循环胆汁酸池的组成,我们已证实这种改变对原发性乳腺癌进展和肺转移具有保护作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




