PRJNA1418987:E2/ERalpha-Ccnl2 轴介导三阴性乳腺癌中 CD8+ T 细胞耗竭与肿瘤进展

该数据集来自 NCBI,主题为 E2/ERalpha-Ccnl2 轴介导三阴性乳腺癌中 CD8+ T 细胞耗竭与肿瘤进展,属于肿瘤/乳腺癌分类,标签为 Raw sequence reads

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时间序列Raw sequence reads
PRJNA1418987: E2/ERalpha-Ccnl2 axis mediates CD8+ T cell exhaustion and tumor progression in triple-negative breast cancer

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

PRJNA1418987:E2/ERalpha-Ccnl2 轴介导三阴性乳腺癌中 CD8+ T 细胞耗竭与肿瘤进展

PRJNA1418987 数据集来自 NCBI,主题为 E2/ERalpha-Ccnl2 轴介导三阴性乳腺癌中 CD8+ T 细胞耗竭与肿瘤进展,本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 Raw sequence reads。该数据集围绕三阴性乳腺癌中 E2/ERalpha-Ccnl2 轴与 CD8+ T 细胞耗竭及肿瘤进展之间的关系展开,属于肿瘤免疫与乳腺癌研究交叉领域。从数据组织形态看,其内容以原始测序读段为主,适合作为相关转录组或测序分析的基础数据来源。整体而言,该数据集为研究三阴性乳腺癌中内分泌信号轴、免疫细胞耗竭状态与肿瘤进展之间潜在联系提供了原始测序层面的数据支撑,可供肿瘤生物学、免疫学及乳腺癌相关研究参考使用。

【数据集背景】

三阴性乳腺癌是乳腺癌中侵袭性较强、治疗选择相对有限的一种亚型,其肿瘤微环境中的免疫状态,尤其是 CD8+ T 细胞的功能状态,与肿瘤进展密切相关。该数据集所对应的研究主题聚焦于 E2/ERalpha-Ccnl2 轴,探讨该轴在介导 CD8+ T 细胞耗竭以及肿瘤进展中的作用。围绕这一主题产生的原始测序读段,可用于支撑对相关分子机制和免疫微环境变化的分析。本站将该数据集归入肿瘤 / 乳腺癌分类,说明其应用语境主要位于肿瘤学与乳腺癌研究范畴。主题标签为 Raw sequence reads,表明数据以原始序列读段形式呈现,而非经过高度加工或汇总的衍生结果。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即原始序列读段。源站描述与数据集英文名一致,均指向 E2/ERalpha-Ccnl2 轴介导三阴性乳腺癌中 CD8+ T 细胞耗竭与肿瘤进展这一研究主题。除上述信息外,关于具体样本数量、测序平台、读长、物种、组织类型、分组设计、数据量大小等细节,源站未提供。因此,该数据集在内容层面可确认的核心信息为:其属于原始测序读段类型,研究语境为三阴性乳腺癌中 E2/ERalpha-Ccnl2 轴与 CD8+ T 细胞耗竭及肿瘤进展的关系。对于需要进一步了解数据构成的研究者,应结合源站页面获取更完整的样本与文件说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集英文名中包含 PRJNA1418987 这一标识,表明其在 NCBI 相关数据库中具有对应项目编号。源站描述与数据集英文名一致,均为 E2/ERalpha-Ccnl2 axis mediates CD8+ T cell exhaustion and tumor progression in triple-negative breast cancer。除来源站和项目标识外,关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验处理流程、测序机构等具体采集与来源细节,源站未提供。因此,在引用或使用该数据集时,应以 NCBI 源站页面所载信息为准,并关注其可能随项目更新而补充的元数据。

【适用场景】

基于其主题标签与分类,该数据集适用于与三阴性乳腺癌、CD8+ T 细胞耗竭、肿瘤进展以及 E2/ERalpha-Ccnl2 轴相关的原始测序数据分析场景。潜在用途包括但不限于:对原始测序读段进行质量控制与预处理,开展转录组或相关测序分析,探索该信号轴与免疫耗竭相关基因表达变化之间的关联,以及为乳腺癌肿瘤免疫微环境研究提供数据基础。由于该数据集被归入肿瘤 / 乳腺癌分类,其适用对象主要为肿瘤学、免疫学、分子生物学及生物信息学研究人员。需要说明的是,具体分析方向仍需结合源站提供的样本设计和实验背景确定,源站未提供的部分不应自行推断。

【使用方法】

该数据集以 Raw sequence reads 形式提供,通常需要先进行原始读段的质量评估与过滤,再根据研究目的开展比对、定量或差异分析等下游处理。由于源站未提供具体的测序平台、读长、样本分组和参考基因组信息,使用前应先在 NCBI 源站页面查阅项目详情,确认数据文件格式、样本对应关系及可用的元数据。对于原始测序读段,一般建议保留原始文件备份,并在分析流程中记录软件版本与参数,以保证结果可重复。若涉及多组比较或免疫相关分析,应依据源站提供的实验设计信息进行分组,避免因元数据不足导致误判。源站未提供的内容,应以源站页面为准,不宜自行假设。

【质量与限制】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,意味着其提供的是原始测序读段,通常需要使用者自行完成质量控制与后续处理。原始读段可能包含接头、低质量碱基或污染序列,具体质量水平取决于源站未提供的建库与测序细节。该数据集的限制在于:除数据集名称、来源、分类、主题标签及简要描述外,关于样本量、测序深度、覆盖度、重复数、批次信息、伦理与知情同意等关键质量信息,源站未提供。因此,在未获取源站完整元数据之前,不宜对该数据集的质量、代表性或可推广性作出确定性判断。使用者应结合源站页面和原始文献评估其适用性。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目标识为 PRJNA1418987。关于该数据集的具体引用格式、作者列表、发表文献、数据许可协议、使用条款及是否允许再分发等引用与许可信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应访问 NCBI 源站页面,依据其项目页面所载的引用要求和数据使用政策执行。若源站页面后续补充了许可或引用信息,应以源站最新内容为准。在源站未提供明确许可说明的情况下,不应默认该数据集可无条件用于任何用途。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1418987

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E2/ERalpha-Ccnl2 axis mediates CD8+ T cell exhaustion and tumor progression in triple-negative breast cancer

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