YKT6促进乳腺癌进展并与不良预后及免疫浸润相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1418360

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：YKT6在多种肿瘤类型中显著高表达，并参与驱动肿瘤进展。然而，YKT6与乳腺癌之间的相关性仍知之甚少。因此，我们旨在探讨YKT6基因在乳腺癌中的潜在预后价值和生物学功能。方法：利用公共数据集、临床样本和组织微阵列（TMA）进行YKT6表达及预后价值分析。使用TCGA数据库分析YKT6表达、肿瘤免疫浸润与肿瘤突变负荷（TMB）之间的关系。通过细胞功能实验验证YKT6在乳腺癌细胞中的生物学行为。此外，采用转录组测序（RNA-seq）探讨YKT6的潜在机制。结果：与正常组织相比，YKT6在乳腺癌组织中显著上调（P < 0.05），且YKT6高表达与较差的临床预后、晚期肿瘤分期和远处转移显著相关（P < 0.05）。此外，YKT6表达与多种免疫细胞的浸润及TMB相关。

敲低YKT6可抑制乳腺癌细胞的增殖、侵袭和迁移，并增加细胞凋亡。功能富集分析显示，YKT6主要通过细胞周期以及自噬、凋亡和铁死亡等生物学过程影响乳腺癌进展。此外，敲低YKT6可抑制mTORC1活性。结论：YKT6可能作为乳腺癌潜在的预后生物标志物。其表达水平与肿瘤浸润免疫细胞相关，可能为乳腺癌患者的治疗提供潜在价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。