PRJNA1415241：反应性间质作为乳腺癌转移的通用预后生物标志物：数字组织病理学与转录组谱整合
该数据集来自 NCBI，主题为反应性间质作为乳腺癌转移的通用预后生物标志物，整合数字组织病理学与转录组谱分析。数据以 Raw sequence reads 形式提供，属于肿瘤/乳腺癌分类
基本信息
资源简介
PRJNA1415241：反应性间质作为乳腺癌转移的通用预后生物标志物：数字组织病理学与转录组谱整合
PRJNA1415241 是一个来自 NCBI 的肿瘤/乳腺癌领域数据集，其英文全称为 Reactive Stroma as a Transversal Prognostic Biomarker for Metastasis in Breast Cancer: Integration of Digital Histopathology and Transcriptomic Profiling。该数据集围绕反应性间质作为乳腺癌转移的通用预后生物标志物这一主题，整合数字组织病理学与转录组谱分析，以 Raw sequence reads 的形式提供数据。从分类上看，它归属于肿瘤 / 乳腺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集面向乳腺癌转移相关的预后生物标志物研究，强调将数字组织病理学信息与转录组层面的分析相结合，为探索反应性间质在乳腺癌转移中的预后价值提供原始序列数据支持。
【数据集背景】
该数据集的主题聚焦于乳腺癌转移的预后生物标志物研究。其英文名称明确指出，研究关注的是“反应性间质”（Reactive Stroma）作为乳腺癌转移的“通用预后生物标志物”（Transversal Prognostic Biomarker），并采用整合数字组织病理学与转录组谱分析的策略。乳腺癌是肿瘤研究中的重要领域，而转移是影响患者预后的关键环节。该数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为 Raw sequence reads，说明其数据以原始序列读长形式呈现，服务于上述研究背景下的转录组相关分析需求。
【数据内容】
该数据集以 Raw sequence reads 形式提供数据。其主题标签明确为 Raw sequence reads，表明数据内容属于原始序列读长类型。数据集英文名称中提及整合数字组织病理学与转录组谱分析，说明其研究设计涉及组织病理学与转录组两个层面的信息整合。关于具体的样本数量、测序平台、读长长度、数据量大小、组织类型细分、患者数量等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其英文名称中包含 PRJNA1415241 这一标识，通常与 NCBI 的公共数据项目相关联。数据集归属于肿瘤 / 乳腺癌分类，主题标签为 Raw sequence reads。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构、研究者信息等，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与数据形式，该数据集适用于与乳腺癌转移预后生物标志物相关的研究场景，尤其是围绕反应性间质这一主题，结合数字组织病理学与转录组谱分析的研究方向。由于数据以 Raw sequence reads 形式提供，可用于转录组层面的原始序列分析。关于具体的适用分析流程、推荐工具、预期应用领域等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 Raw sequence reads 形式提供，属于原始序列读长数据。关于具体的数据下载方式、预处理步骤、质量控制流程、比对或组装方法、分析软件推荐等，源站未提供。
【质量与限制】
关于该数据集的质量评估指标、数据完整性、覆盖度、测序深度、批次效应、样本代表性等质量相关信息，源站未提供。关于其使用限制、数据访问权限、是否存在受控访问要求等，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发等引用与许可相关信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1415241
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
反应性间质作为乳腺癌转移的横向预后生物标志物：数字组织病理学与转录组谱分析的整合
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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