基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-11-03

资源简介

酒精对青春期与成年MMTV Wnt1小鼠肠道微生物组的影响

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项生物学研究项目，编号 1248563，英文名称为“PRJNA1248563: Effects of alcohol on gut microbiome in adolescent and adult MMTV Wnt1-mice”。从名称可以看出，该研究关注酒精暴露对肠道微生物组的影响，研究对象为青春期与成年阶段的 MMTV Wnt1 小鼠。MMTV Wnt1 小鼠是乳腺癌研究中常用的转基因模型，因此该数据集在分类上归属于肿瘤/乳腺癌方向。数据主题标签为“Raw sequence reads”，表明项目产生的数据以原始测序读段为主。整体来看，这是一个围绕酒精、肠道微生物组与乳腺癌模型小鼠之间关系展开的测序项目，适合用于微生物组与肿瘤相关交叉领域的研究参考。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1248563。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的各类生物学数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体，并为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。本项目聚焦于酒精对肠道微生物组的影响，研究对象为 MMTV Wnt1 小鼠，并区分青春期与成年两个阶段。由于 MMTV Wnt1 小鼠属于乳腺癌研究中的经典模型，该数据集被归入肿瘤/乳腺癌类别，具有微生物组与肿瘤模型交叉研究的背景特征。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据内容以原始测序读段为主。项目名称表明研究涉及酒精暴露、肠道微生物组以及青春期和成年 MMTV Wnt1 小鼠等要素。除此之外，关于样本数量、测序平台、读长、数据量、具体微生物类群或差异分析结果等信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目 ID 为 1248563。源站描述指出，BioProject 记录用于汇集来自单一机构或联合体的生物学数据，并提供指向该项目所生成多种数据类型的链接。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构或资助来源等，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集可适用于与肠道微生物组、酒精暴露影响、乳腺癌模型小鼠相关的探索性研究场景。由于主题标签为原始测序读段，可能适合用于微生物组测序数据的再分析或方法学参考。但具体适用场景需结合项目实际样本设计与元数据判断，源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 条目进行访问，项目 ID 为 1248563。用户可在 BioProject 记录中查找该项目关联的多种数据类型链接。关于具体下载方式、数据格式、分析流程或软件工具等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开数据库收录的项目记录。关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、批次效应、样本量或统计功效等信息，源站未提供。使用时应结合原始项目记录自行判断其适用性与局限性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。使用者在利用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 页面及相关数据发布方的要求进行引用与合规使用。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1248563

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数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1248563

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含一项研究的原始序列，该研究探讨了酒精在乳腺癌背景下如何影响微生物群落。我们使用16S rRNA基因测序（V3V4区域）分析了Wnt1转基因小鼠及其野生型FVB对照小鼠的粪便样本。小鼠在青春期或成年期暴露于酒精，以观察年龄和遗传背景如何影响微生物组变化。我们观察到，酒精暴露导致微生物多样性降低，尤其是在成年小鼠中，并且随着时间推移改变了整体微生物组成。这些数据有助于我们理解酒精如何通过肠道微生物组的变化促进炎症和肿瘤进展。doi: 10.3389/fonc.2025.1557040

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别