基本信息

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基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

早期三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗中肠道微生物组与肿瘤免疫动态关系的前瞻性纵向分析

该数据集在 NCBI BioProject 中的英文名称为“PRJDB42181: Relationship between the gut microbiome and tumor immune dynamics in early-stage triple-negative breast cancer treated with neoadjuvant chemo-immunotherapy: A prospective longitudinal analysis”，源站标题为“Homo sapiens (ID 1457830) - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站分类归入肿瘤 / 乳腺癌。从标题可以看出，该数据集围绕早期三阴性乳腺癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗过程中，肠道微生物组与肿瘤免疫动态之间的关系展开，研究设计为前瞻性纵向分析，涉及物种为 Homo sapiens。主题标签为 Targeted Locus (Loci)。整体而言，该数据集属于 NCBI BioProject 体系下的一项生物学研究项目记录，旨在为相关研究提供统一的数据入口，便于查找该项目所产生的多种数据类型。

【数据集背景】

该数据集所属的研究方向聚焦于早期三阴性乳腺癌的新辅助化疗免疫治疗。三阴性乳腺癌是乳腺癌的一种亚型，其治疗策略与免疫微环境、机体整体状态之间的关系是肿瘤学研究关注的内容之一。该数据集标题明确指出，研究关注的是肠道微生物组与肿瘤免疫动态之间的关系，并采用前瞻性纵向分析的设计，意味着研究可能在一段时间内对同一群体进行多次观察，以捕捉微生物组与免疫动态的变化。该数据集来源于 NCBI BioProject，BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议而组织的生物数据集合，通常由单一机构或联盟发起，并为用户提供查找该项目所生成各类数据的统一入口。该数据集的物种为 Homo sapiens，本站分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为 Targeted Locus (Loci)。

【数据内容】

源站描述指出，BioProject 记录本身是围绕单一研究计划组织的生物数据集合，提供用户查找该项目所生成多种数据类型的统一位置。因此，该数据集在 BioProject 层面主要作为项目记录存在，用于汇集与该项目相关的数据链接。关于该项目具体包含哪些数据文件、样本数量、测序深度、微生物组检测方法、免疫动态指标类型等详细内容，源站未提供。主题标签为 Targeted Locus (Loci)，提示该项目可能涉及特定基因座或靶向位点相关的内容，但具体靶向位点信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 1457830) - BioProject - NCBI”。其英文名称中包含 PRJDB42181 这一项目编号，表明该记录属于 BioProject 体系。研究标题表明其设计为前瞻性纵向分析，研究对象为接受新辅助化疗免疫治疗的早期三阴性乳腺癌患者，涉及肠道微生物组与肿瘤免疫动态。关于样本采集地点、采集时间跨度、纳入排除标准、伦理审批信息、具体检测平台等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于查找与早期三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗相关的肠道微生物组与肿瘤免疫动态研究项目。由于 BioProject 提供统一入口以链接该项目生成的多种数据类型，研究人员可借助该记录定位相关数据资源，用于了解该研究计划所涉及的数据类型与范围。其主题标签 Targeted Locus (Loci) 可能有助于在涉及靶向位点的研究场景中进行检索与关联。关于该数据集是否适用于特定分析流程、能否直接用于二次分析等，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供，用户可通过来源站 ncbi.nlm.nih.gov 访问该记录，并借助 BioProject 提供的统一入口查找该项目所链接的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、文件格式、访问权限、是否需要申请、配套分析工具等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于项目层面的记录。源站描述仅说明 BioProject 是围绕单一研究计划组织的生物数据集合，并提供查找多种数据类型的统一位置，未提供关于数据质量、完整性、准确性或使用限制的具体说明。关于样本量、数据缺失情况、批次效应、技术偏差等，源站未提供。该数据集标题中提及前瞻性纵向分析，但具体研究实施质量与数据质量控制措施，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 1457830) - BioProject - NCBI”，英文名称中包含项目编号 PRJDB42181。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发等，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB42181

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB42181

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是通过纵向分析肿瘤免疫特征和肠道微生物组组成，识别预测早期三阴性乳腺癌接受新辅助免疫检查点抑制剂治疗的应答和免疫相关不良事件的生物标志物。本研究关注治疗过程中基质肿瘤浸润淋巴细胞和肠道微生物谱的动态变化，而非基线特征。通过将免疫重塑和特定微生物分类群与病理完全缓解相关联，本研究旨在改进免疫治疗中疗效和毒性的预测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别