PRJDB18221：CDK4抑制剂对乳腺癌细胞影响的RNA-seq与ChIP-seq数据
在Heregulin刺激乳腺癌细胞系MCF7细胞后，分析了其对细胞周期信号的影响。数据来自一项时间序列实验，旨在研究使用CDK4抑制剂（一种细胞周期G1/S转换抑制剂）对基因表达调控的影响
基本信息
资源简介
PRJDB18221：CDK4抑制剂对乳腺癌细胞影响的RNA-seq与ChIP-seq数据
PRJDB18221 是一个聚焦乳腺癌细胞周期调控的转录组与染色质免疫共沉淀测序数据集，英文全称为“RNA-seq and ChIP-seq, the effect of CDK4 inhibitor on breast cancer cells”。该数据集以乳腺癌细胞系 MCF7 为研究对象，在 Heregulin 刺激后考察细胞周期信号的变化，并通过时间序列实验设计，研究 CDK4 抑制剂（一种细胞周期 G1/S 转换抑制剂）对基因表达调控的影响。数据同时包含 RNA-seq 与 ChIP-seq 两类测序信息，可用于从转录水平和染色质层面观察细胞周期信号通路在药物干预下的动态响应。数据集归入肿瘤/乳腺癌分类，来源站为 ebi.ac.uk。
【数据集背景】
乳腺癌细胞周期信号异常与肿瘤发生发展密切相关，G1/S 转换是细胞周期调控的关键节点。CDK4 作为驱动 G1/S 转换的激酶，其抑制剂已成为研究细胞周期干预的重要工具。该数据集围绕 Heregulin 刺激乳腺癌细胞系 MCF7 后细胞周期信号的变化展开，目的在于通过时间序列实验，揭示 CDK4 抑制剂对基因表达调控的影响，为理解乳腺癌细胞周期信号的可干预性提供数据基础。
【数据内容】
数据集包含 RNA-seq 与 ChIP-seq 两类数据。RNA-seq 用于刻画基因表达水平，ChIP-seq 用于从染色质层面提供信息。实验涉及 Heregulin 刺激的 MCF7 细胞，并设置时间序列以观察 CDK4 抑制剂作用下的动态变化。源站未提供样本数量、测序平台、读长、数据量等具体技术参数。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk，数据集标识为 PRJDB18221。实验对象为乳腺癌细胞系 MCF7，处理条件包括 Heregulin 刺激与 CDK4 抑制剂干预，实验类型为时间序列设计。源站未提供具体的采集流程、建库方法、测序仪器及数据处理步骤。
【适用场景】
该数据集适用于研究乳腺癌细胞中细胞周期信号调控、G1/S 转换相关基因表达变化，以及 CDK4 抑制剂干预下的转录与染色质响应。可用于时间序列层面的差异表达分析、通路层面的细胞周期信号分析，以及 RNA-seq 与 ChIP-seq 的联合观察。源站未提供具体的适用分析流程或验证结论。
【使用方法】
使用时可依据时间序列设计，对 CDK4 抑制剂处理与对照条件下的 RNA-seq 数据进行表达变化分析，并结合 ChIP-seq 数据观察染色质层面的响应。源站未提供数据下载地址、文件格式、预处理步骤及分析工具等具体使用说明。
【质量与限制】
源站未提供数据质量评估指标、批次信息、重复数及质控结果。由于仅涉及 MCF7 细胞系与 Heregulin 刺激及 CDK4 抑制剂处理条件，结论外推到其他细胞系或体内场景需谨慎。源站未提供其他限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB18221
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在使用Heregulin刺激乳腺癌细胞系MCF7细胞后，分析了其对细胞周期信号传导的影响。数据来自一项时间过程实验，旨在研究使用CDK4抑制剂（一种细胞周期G1/S转换抑制剂）对基因表达调控的影响。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
