PRJDB17249：癌细胞中Hippo通路诱导免疫抑制性NCAM1+aSMA+成纤维细胞
肿瘤细胞善于操纵肿瘤微环境（TME）以逃避免疫系统的抗肿瘤免疫，但肿瘤细胞内在信号在塑造TME免疫抑制方面的作用仍未被充分探索
基本信息
资源简介
PRJDB17249：癌细胞中Hippo通路诱导免疫抑制性NCAM1+aSMA+成纤维细胞
PRJDB17249 数据集围绕肿瘤细胞内在信号如何塑造免疫抑制性肿瘤微环境这一主题展开，聚焦 Hippo 通路在乳腺癌中对癌症相关成纤维细胞（CAF）组成的调控作用。源站描述指出，肿瘤细胞能够巧妙地操纵肿瘤微环境以逃避免疫系统的抗肿瘤免疫，而肿瘤细胞内在信号在塑造微环境免疫抑制方面的作用此前仍未被充分探索。该数据集以 4T1 小鼠乳腺癌模型为主要研究场景，揭示 Hippo 通路激酶 LATS1/2 促进表达 TGFb 的免疫抑制性 NCAM1+aSMA+ CAF 形成，进而导致 T 细胞功能障碍；肿瘤细胞中 LATS1/2 的缺失则使微环境免疫抑制性减弱，表现为 NCAM1+aSMA+ CAF 比例下降和功能障碍 T 细胞减少。类似的 Hippo 通路诱导的 NCAM1+aSMA+ CAF 也在人类乳腺癌中被识别。本站将其归类为肿瘤／乳腺癌数据集，来源站为 ebi.ac.uk。
【数据集背景】
肿瘤微环境由多种细胞成分构成，其中癌症相关成纤维细胞是影响抗肿瘤免疫的重要参与者。源站描述强调，肿瘤细胞善于操纵肿瘤微环境以逃避免疫攻击，但肿瘤细胞内在信号如何塑造微环境的免疫抑制特性仍缺乏充分研究。该数据集所对应的研究正是在这一背景下，探讨 Hippo 通路作为肿瘤细胞内在信号在决定 CAF 组成和免疫抑制状态中的作用，并以乳腺癌为研究对象展开分析。
【数据内容】
依据源站描述，该数据集涉及的核心内容包括：在 4T1 小鼠乳腺癌模型中，Hippo 通路激酶 LATS1/2 在促进免疫抑制性 NCAM1+aSMA+ CAF 形成中的关键作用；这类 CAF 表达 TGFb，并参与导致 T 细胞功能障碍；肿瘤细胞中 LATS1/2 缺失后，肿瘤微环境免疫抑制性减弱，NCAM1+aSMA+ CAF 比例降低，功能障碍 T 细胞数量减少；此外，在人类乳腺癌中也识别到类似的由 Hippo 通路诱导的 NCAM1+aSMA+ CAF。关于数据集的具体样本数量、测序类型、文件格式与数据规模，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述提及的研究使用 4T1 小鼠乳腺癌模型，并在人类乳腺癌中进行了相应观察。除来源站与上述模型信息外，关于样本采集地点、时间、伦理审批及具体实验流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与乳腺癌肿瘤微环境、癌症相关成纤维细胞异质性、Hippo 通路信号以及肿瘤免疫抑制机制相关的研究场景。具体而言，可用于关注 NCAM1+aSMA+ CAF 的形成与功能、TGFb 相关免疫抑制、LATS1/2 激酶对微环境组成的影响，以及小鼠模型与人类乳腺癌之间对应关系的分析。关于数据的具体适用分析类型与配套工具，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、预处理步骤、分析流程与软件要求等。
【质量与限制】
源站描述提供了研究层面的主要发现，但未提供数据集层面的质量评估指标、数据完整性说明或技术验证细节。该数据集基于 4T1 小鼠乳腺癌模型并辅以人类乳腺癌中的观察，其结论的外推范围应结合源站描述所限定的研究背景理解。关于数据质量与使用限制的更多信息，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB17249
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
肿瘤细胞善于操纵肿瘤微环境（TME）以逃避免疫系统的抗肿瘤免疫，但肿瘤细胞内在信号在塑造TME免疫抑制特性中的作用仍未得到充分探索。在此，我们揭示肿瘤细胞内的Hippo通路通过影响癌症相关成纤维细胞（CAFs）的组成来编排免疫抑制性TME。在4T1小鼠乳腺癌模型中，Hippo通路激酶LATS1/2（大型肿瘤抑制因子1和2）被证明在促进表达TGFb的免疫抑制性NCAM1+aSMA+ CAF形成中起关键作用，从而导致T细胞功能障碍。肿瘤细胞中LATS1/2的缺失导致TME免疫抑制性降低，其特征是NCAM1+aSMA+ CAFs比例减少和功能障碍T细胞数量减少。值得注意的是，在人类乳腺癌中也鉴定出类似的Hippo通路诱导的NCAM1+aSMA+ CAFs，这为旨在操纵与减少免疫抑制相关的TME模式的癌症免疫疗法提供了潜在启示。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
