PRJDB13249:SerpinB2缺陷乳腺肿瘤转录组分析为解析SerpinB2介导的乳腺癌进展作用提供线索

SerpinB2在免疫细胞和肿瘤细胞中高表达,并参与多种生物学功能,包括细胞存活和促进疾病进展的重塑。本项目制备了SerpinB2缺陷小鼠,并分析了差异表达基因(DEGs),以确定该蛋白缺失是否会延缓乳腺肿瘤进展

ena
浏览 20
基因组分类转录组测序基因表达谱乳腺癌肿瘤进展免疫微环境差异表达分析小鼠模型
PRJDB13249: Transcriptome analysis of SerpinB2-deficient breast tumors provides insight into deciphering SerpinB2-mediated roles in breast cancer progression

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

PRJDB13249:SerpinB2缺陷乳腺肿瘤转录组分析为解析SerpinB2介导的乳腺癌进展作用提供线索

SerpinB2在免疫细胞和肿瘤细胞中高表达,并参与多种生物学功能,包括细胞存活和促进疾病进展的重塑。本项目制备了SerpinB2缺陷小鼠,并分析了差异表达基因(DEGs),以确定该蛋白缺失是否会延缓乳腺肿瘤进展

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):SerpinB2在免疫细胞和肿瘤细胞中高表达,并参与多种生物学功能,包括细胞存活和促进疾病进展的重塑。本项目制备了SerpinB2缺陷小鼠,并分析了差异表达基因(DEGs),以确定该蛋白缺失是否会延缓乳腺肿瘤进展。

【主题与分类】

主题标签:转录组测序、基因表达谱、乳腺癌、肿瘤进展、免疫微环境、差异表达分析、小鼠模型。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB13249

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB13249

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

SerpinB2在免疫细胞和肿瘤细胞中高表达,并参与多种生物学功能,包括细胞存活和促进疾病进展的重塑。本项目制备了SerpinB2缺陷小鼠,并分析了差异表达基因(DEGs),以确定该蛋白缺失是否会延缓乳腺肿瘤进展。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案