phs001428:S0221试验乳腺癌化疗毒性全基因组关联研究

phs001428: GWAS for Breast Cancer Chemotherapy Toxicities in S0221 是一个由 ncbi.nlm.nih.gov 收录的 dbGaP 研究,围绕乳腺癌化疗毒性相关的全基因组关联分析展开;在站点分类中属于肿瘤/乳腺癌,并被标注为临床试验与

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基因组分类Clinical Trial, Cohort
phs001428: GWAS for Breast Cancer Chemotherapy Toxicities in S0221

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

phs001428:S0221试验乳腺癌化疗毒性全基因组关联研究

phs001428: GWAS for Breast Cancer Chemotherapy Toxicities in S0221 是一个由 ncbi.nlm.nih.gov 收录的 dbGaP 研究,围绕乳腺癌化疗毒性相关的全基因组关联分析展开;在站点分类中属于肿瘤/乳腺癌,并被标注为临床试验与队列类型。源站没有给出更简短的内容摘要,因此无法进一步压缩为一句更具体的话。

【数据集背景】

来源站点将该资源描述为 dbGaP study,类型涉及 Clinical Trial 与 Cohort。在肿瘤学研究里,乳腺癌治疗相关毒性是影响患者耐受性和治疗决策的重要问题,全基因组关联分析常用于探索遗传差异与药物反应或不良反应之间的联系。该数据集名称包含 S0221 这一研究标识,但源站未提供 S0221 的具体设计、试验阶段、药物方案、入组标准、随访安排或研究结论。除了试验与队列这两个类型标签外,关于研究发起方、协作网络、临床背景和目标假设,源站未提供。

【数据内容】

从名称可看出其主题为乳腺癌化疗毒性,并以 GWAS 为研究框架。然而,数据内容细节如样本数量、遗传标记数量、基因分型平台、表型定义、毒性分级标准、临床协变量、治疗暴露信息、随访时间点、原始数据与汇总统计结果等,源站均未提供。该数据集在来源站点被描述为 dbGaP study,并带有 Clinical Trial 与 Cohort 标签,说明其组织形态与临床试验和队列研究有关,但具体涉及哪些文件、哪些变量、何种数据结构,源站未提供。

【采集与来源】

来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。来源站将其描述为 Clinical Trial, Cohort,主题标签也包括 Clinical Trial 和 Cohort。因而可确认该资源与临床试验和队列研究有关,但采集地点、采集时间、参与机构、受试者来源、伦理审查信息、知情同意方式、样本处理流程和分子检测方法等,源站未提供。名称中的 S0221 是一个研究标识,源站未对其含义作进一步说明。

【适用场景】

该数据集名称指向乳腺癌化疗毒性的全基因组关联研究,因此适合作为探索乳腺癌患者化疗毒性遗传相关性的候选资源。潜在使用方向可能包括遗传关联分析、药物基因组学探索、毒性表型与基因变异的关联验证等;但这些方向是否与该数据集的实际设计匹配,取决于源站文档和数据访问条件,源站未提供具体适用场景、分析建议或已验证的研究用途。对于需要明确样本构成、终点定义和统计模型的研究,现有信息不足以判断其适用性。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括访问申请流程、授权级别、下载方式、文件组织、数据格式、配套文档位置、分析工具或代码示例。由于来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,相关访问通常需要遵循该站点及其 dbGaP 的通用流程,但本数据集的具体要求源站未提供。使用者应以来源站点页面上的说明为准,并自行确认是否需要数据使用协议、机构审查或伦理批准。源站未提供任何逐步操作指南。

【质量与限制】

源站未提供质量评估信息,包括样本量、基因型质控、表型可靠性、缺失数据比例、群体分层控制、统计功效、重复验证、混杂因素处理、批次效应校正等。因此无法从现有信息判断数据的完整性、准确性、代表性或可推广性。该数据集被标注为临床试验与队列,但这并不等同于已经说明其质量水平;源站未提供质量指标、局限性说明、已知偏倚或使用警告。使用者需要自行查阅来源站点的完整文档来评估适用性。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、文献出处、许可条款、数据使用协议、访问限制、商业使用规定、再分发条件或致谢要求。由于来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,且该资源属于 dbGaP 研究,引用与许可应遵循来源站点及 dbGaP 的相关政策,但本数据集的具体要求源站未提供。若计划在发表或后续研究中使用,应直接查阅来源站点页面获取正式引用和授权信息。源站未提供任何可引用的文献列表或许可声明文本。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001428

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Clinical Trial, Cohort).

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