SUCCESS 试验乳腺癌患者全基因组关联研究

该数据集为 dbGaP 收录的 SUCCESS 试验乳腺癌患者全基因组关联研究,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/乳腺癌分类

dbgap
浏览 8
基因组预测Prospective, Randomized, Phase III
phs000547: A Genome-Wide Association Study in Breast Cancer Patients from the SUCCESS Trial

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

SUCCESS 试验乳腺癌患者全基因组关联研究

phs000547 是一项收录于 dbGaP 的乳腺癌全基因组关联研究数据集,研究对象来自 SUCCESS 试验的乳腺癌患者。该数据集在来源站 ncbi.nlm.nih.gov 上登记为一项前瞻性、随机、III 期研究,本站将其归入肿瘤 / 乳腺癌分类。围绕这一数据集,可以了解其研究背景、数据类型、采集来源、适用场景、使用方式以及质量与引用方面的基本信息,以下分项说明。

【数据集背景】

该数据集对应的研究为 SUCCESS 试验中的乳腺癌患者全基因组关联研究。根据来源站描述,该研究是一项前瞻性、随机、III 期研究,主题标签同样标注为 Prospective、Randomized、Phase III。数据集英文名称为 phs000547: A Genome-Wide Association Study in Breast Cancer Patients from the SUCCESS Trial,表明其核心内容是在 SUCCESS 试验的乳腺癌患者群体中开展的全基因组关联分析。数据集由 ncbi.nlm.nih.gov 收录,本站分类为肿瘤 / 乳腺癌。

【数据内容】

该数据集为一项全基因组关联研究,研究对象为来自 SUCCESS 试验的乳腺癌患者。关于具体的样本数量、基因分型平台、位点数量、临床变量种类、随访时间跨度等细节,源站未提供。数据集的主题标签为前瞻性、随机、III 期,反映其所属研究的总体设计特征。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,登记形式为 dbGaP 研究。源站描述指出该研究为前瞻性、随机、III 期研究。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于其作为乳腺癌患者全基因组关联研究的定位,该数据集可用于与乳腺癌遗传关联分析相关的研究场景。关于具体的适用分析类型、可支持的统计方法或研究问题,源站未提供。

【使用方法】

关于数据集的访问方式、下载途径、数据格式、配套分析工具或使用协议,源站未提供。

【质量与限制】

关于数据质量评估、缺失率、质控标准以及使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于数据集的引用方式、许可条款或使用规定,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000547

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Prospective, Randomized, Phase III).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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