NHLBI TOPMed - NHGRI CCDG:Malmö预防项目(MPP)

Malmö预防项目(MPP)是一项基于社区的疾病预防计划,纳入瑞典南部马尔默市的33,346名居民。项目邀请1921至1949年间出生的完整出生队列,参与率为71%

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基因组预测乳腺癌心血管风险因素DNA样本房颤队列研究瑞典人群
NHLBI TOPMed - NHGRI CCDG: Malmo Preventive Project (MPP)

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23
版本
3

资源简介

NHLBI TOPMed - NHGRI CCDG:Malmö预防项目(MPP)

NHLBI TOPMed - NHGRI CCDG: Malmo Preventive Project (MPP) 数据集来自 doi.org,作者为 Ellinor, Patrick,所属机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布时间为 2023 年。该数据集对应瑞典南部马尔默市的 Malmö 预防项目(MPP),这是一项基于社区的疾病预防计划,纳入 33,346 名居民,邀请 1921 至 1949 年间出生的完整出生队列参与,参与率为 71%。在本站分类中,该数据集归入肿瘤 / 乳腺癌方向。数据集围绕心血管风险因素、酒精滥用与乳腺癌筛查等社区预防性检查展开,并包含后续再检查中采集的血样及提取的 DNA 信息,以及基于全国登记资料识别的房颤病例与匹配对照。

【数据集背景】

Malmö 预防项目(MPP)是一项基于社区的疾病预防计划,覆盖瑞典南部马尔默市的 33,346 名居民。项目邀请 1921 至 1949 年间出生的完整出生队列参加,参与率达到 71%。参与者在 1974 年至 1992 年间接受筛查,筛查内容涉及心血管风险因素、酒精滥用和乳腺癌。该项目属于社区层面的疾病预防与风险因素筛查实践,其人群基础为特定出生队列的居民,因而具有明确的社区来源与出生队列特征。

【数据内容】

该数据集涉及的内容包括参与者在 1974 年至 1992 年间的筛查信息,筛查方向为心血管风险因素、酒精滥用和乳腺癌。2002 年至 2006 年间,存活参与者被邀请参加再检查,再检查包括采血,并从中提取 DNA。此外,研究还从全国登记资料中识别出患病或新发房颤的受试者,并将带有 DNA 的病例与同一队列中带有 DNA 的对照按性别、年龄(±1 岁)以及基线检查日期(±1 岁)进行 1:1 匹配;对照还要求其随访时间长于对应的房颤病例。数据集中具体包含哪些变量、字段与文件格式,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于瑞典马尔默市的社区预防项目。参与者为 1921 至 1949 年间出生的完整出生队列,参与率为 71%,筛查时间为 1974 年至 1992 年。2002 年至 2006 年的再检查采集了血样并提取 DNA。房颤病例的识别依据全国登记资料,病例与对照的匹配在同一队列内完成,匹配条件包括性别、年龄(±1 岁)和基线检查日期(±1 岁),并要求对照的随访时间长于对应病例。数据集发布来源站为 doi.org,作者为 Ellinor, Patrick,机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布时间为 2023 年。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于涉及社区人群心血管风险因素、酒精滥用和乳腺癌筛查的研究场景,也可用于围绕房颤病例与匹配对照开展的遗传或生物标志物相关分析,尤其是利用再检查阶段提取的 DNA 进行病例对照研究。由于数据包含按性别、年龄和基线检查日期匹配的房颤病例与对照,并附带 DNA 信息,适合用于需要严格匹配设计的观察性研究。其他具体适用场景源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括访问方式、数据下载形式、分析流程或配套工具等均未说明。

【质量与限制】

该项目的参与率为 71%,参与者来自 1921 至 1949 年间出生的完整出生队列,筛查时间为 1974 年至 1992 年,再检查时间为 2002 年至 2006 年。房颤病例与对照的匹配依据性别、年龄(±1 岁)和基线检查日期(±1 岁),并要求对照随访时间长于对应病例。除上述信息外,关于数据质量评估、缺失情况、样本量细节及使用限制等内容,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Ellinor, Patrick,机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布时间为 2023 年,来源站为 doi.org。关于引用格式与许可条款的具体内容,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.60645/bdc-k232-j941

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

马尔默预防项目(MPP)是一项以社区为基础的疾病预防计划,纳入了瑞典南部马尔默市的33,346名居民。该项目邀请了1921年至1949年间出生的完整出生队列,参与率为71%。参与者在1974年至1992年间接受了心血管危险因素、酒精滥用和乳腺癌的筛查。2002年至2006年间,存活参与者被邀请参加复查,复查包括采血并从中提取DNA。如前所述,从国家登记册中识别出患有现患或新发房颤的受试者,随后将携带DNA的病例按性别、年龄(±1岁)和基线检查日期(±1岁)与来自同一队列的携带DNA的对照进行1:1匹配。此外,对照的随访时间需超过相应房颤病例的随访时间。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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