MICRON实验数据与资源
该存储库提供MICRON实验所使用的数据集资源与训练/测试划分信息，覆盖三个影像质谱流式（IMC）数据集：脑肿瘤、乳腺癌和糖尿病
基本信息
资源简介
MICRON实验数据与资源
MICRON: Experimental Data and Resources 是一个面向影像质谱流式（IMC）实验的数据集资源存储库，提供 MICRON 实验中所使用的数据集资源以及训练/测试划分信息，覆盖脑肿瘤、乳腺癌和糖尿病三个 IMC 数据集。该资源由 University of North Carolina Chapel Hill 提供，存放于 Zenodo，发布时间为 2026 年，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。在本站分类中，该数据集归入肿瘤 / 乳腺癌方向。其来源站为 doi.org，源站描述重点介绍了脑肿瘤与乳腺癌两个 IMC 数据集的组织方式、样本构成与分类任务，为研究者复现和比较 MICRON 实验提供了数据基础与划分依据。
【数据集背景】
MICRON 实验围绕影像质谱流式（IMC）数据展开，需要在多个不同疾病背景的数据集上开展训练与测试。该存储库正是为这些实验提供数据集资源与训练/测试划分信息的载体，覆盖脑肿瘤、乳腺癌和糖尿病三个 IMC 数据集。其中脑肿瘤数据集来自 Karimi 等人的工作，乳腺癌数据集来自 Jackson 等人的工作；糖尿病数据集在源站描述中仅被列为三个数据集之一，其具体内容源站未提供。存储库由 University of North Carolina Chapel Hill 提供，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年。
【数据内容】
源站描述详细说明了脑肿瘤数据集的构成：该 IMC 数据集刻画了肿瘤微环境，涵盖 139 例原发性胶质母细胞瘤（GBM）患者和 46 例转移性脑肿瘤（BrM）患者。每个样本考虑 18 个跨样本共享的常见通道，其中包含 17 个蛋白质标记物。样本取自不同的组织区域，包括肿瘤核心、侵袭边缘和邻近非恶性组织。由于部分患者贡献了多个空间区域，数据集最终包含 270 个 GBM 样本和 123 个 BrM 样本。该数据集的分类任务是将原发性胶质母细胞瘤与转移性脑肿瘤区分开来。乳腺癌数据集（Jackson 等）在源站描述中仅开头提及，其样本量、通道构成与分类任务等具体内容源站未提供；糖尿病数据集的具体内容源站未提供。
【采集与来源】
该存储库的来源站为 doi.org，机构为 Zenodo，提供方为 University of North Carolina Chapel Hill。脑肿瘤数据集来源于 Karimi 等人的工作，乳腺癌数据集来源于 Jackson 等人的工作，二者均为影像质谱流式（IMC）数据。脑肿瘤样本取自肿瘤核心、侵袭边缘和邻近非恶性组织等不同组织区域，部分患者贡献多个空间区域。糖尿病数据集的采集来源与样本信息源站未提供。
【适用场景】
依据源站描述，该资源适用于 MICRON 实验相关的数据集资源获取与训练/测试划分使用，覆盖脑肿瘤、乳腺癌和糖尿病三个 IMC 数据集。就脑肿瘤数据集而言，其明确的分类任务为区分原发性胶质母细胞瘤与转移性脑肿瘤，可用于围绕肿瘤微环境 IMC 数据的分类实验。乳腺癌与糖尿病数据集在 MICRON 实验中的具体任务设定源站未提供。
【使用方法】
该存储库提供 MICRON 实验所使用的数据集资源与训练/测试划分信息，使用者可据此获取相应数据集并按照所提供的划分开展训练与测试。各数据集的具体文件组织、读取方式与预处理流程源站未提供。
【质量与限制】
脑肿瘤数据集包含 18 个常见通道（17 个蛋白质标记物），样本覆盖肿瘤核心、侵袭边缘和邻近非恶性组织等不同组织区域；由于部分患者贡献多个空间区域，样本数与患者数并不一一对应（270 个 GBM 样本对应 139 例 GBM 患者，123 个 BrM 样本对应 46 例 BrM 患者）。乳腺癌与糖尿病数据集的质量信息与限制条件源站未提供。
【引用与许可】
该数据集英文名为 MICRON: Experimental Data and Resources，提供方为 University of North Carolina Chapel Hill，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。源站描述中提及脑肿瘤数据集来自 Karimi 等人、乳腺癌数据集来自 Jackson 等人，具体引用格式与文献信息源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23644896
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.28 GB。
数据说明
该仓库提供了MICRON实验中所使用的数据集资源和训练/测试划分信息，涵盖三个成像质谱流式（IMC）数据集：脑肿瘤、乳腺癌和糖尿病。脑肿瘤数据集（Karimi等）脑肿瘤IMC数据集对139例原发性胶质母细胞瘤（GBM）患者和46例转移性脑肿瘤（BrM）患者的肿瘤微环境进行了分析。对于每个样本，我们考虑了样本间共享的18个常见通道（17种蛋白质标志物）。样本取自不同的组织区域，包括肿瘤核心、浸润边缘和邻近非恶性组织。由于某些患者贡献了多个空间区域，该数据集包含270个GBM样本和123个BrM样本。分类任务是将原发性胶质母细胞瘤与转移性脑肿瘤区分开来。乳腺癌数据集（Jackson等）乳腺癌IMC数据集使用52个成像通道（包括40种蛋白质标志物）对原发性乳腺肿瘤组织进行了分析。该数据集包含376个肿瘤样本，其中274个样本来自末次随访时仍存活的患者，102个样本来自已死亡的患者。
该分类任务根据二元生存状态（存活或死亡）区分样本。糖尿病数据集（Damond等）。糖尿病IMC数据集对来自67名供体的胰腺组织样本进行了分析，包括33名非糖尿病供体和34名1型糖尿病（T1D）供体。该分类任务区分非糖尿病样本与T1D样本。数据可用性与可重复性。此处提供了MICRON实验中使用的训练/测试划分文件，以促进可重复性。原始乳腺癌和糖尿病影像数据及相关注释可通过各自出版物提供的数据集资源获取。对于乳腺癌和糖尿病实验，用户可按照为t所展示的相同目录结构和文件组织方式整理下载的数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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