国际癌症蛋白质基因组学联盟（ICPC）：东亚乳腺癌蛋白质基因组学
东亚乳腺癌蛋白质基因组学数据集，包含台湾早期队列的多层组学数据，用于解析疾病异质性和致癌机制。
基本信息
资源简介
国际癌症蛋白质基因组学联盟（ICPC）：东亚乳腺癌蛋白质基因组学
【一句话概览】
东亚侵袭性乳腺癌发病率快速上升，患者更趋年轻且以luminal型为主。研究在台湾前瞻性入组早期队列，构建多层次蛋白质基因组图谱，揭示内源性与环境致癌物相关突变特征，将APOBEC与DBAC特征与年轻患者激素生物合成及化学致癌显著升高相联系，并识别出高突变负荷与免疫逃逸的新亚群。数据关联PRJNA（来源 NCBI）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《International Cancer Proteogenomics Consortium (ICPC): Proteogenomics of East-Asian Breast Cancer》。源站首次发布：2022-12-23。
【数据内容】
源站原始描述：The incidence of invasive breast cancer is rapidly increasing in East Asia, enriching in younger patients and luminal disease. We presented a deep proteogenomic landscape of a prospectively enrolled early-stage cohort in Taiwan to uncover the etiology, age-related subtype and oncogenic vulnerabilities underlying the heterogeneous disease. Multilayer proteogenomic architecture revealed distinct endogenous and environmental carcinogen-associated mutagenesis, linking APOBEC (apolipoprotein-B mRNA e…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：浸润性乳腺癌的发病率在东亚迅速上升，在年轻患者和 luminal 型疾病中占比日益增加。我们展示了一个在台湾前瞻性入组的早期队列的深度蛋白质基因组图谱，以揭示这种异质性疾病背后的病因、年龄相关亚型和致癌脆弱性。多层蛋白质基因组架构揭示了不同的内源性和环境致癌物相关突变发生，将 APOBEC（载脂蛋白 B mRNA 编辑酶催化多肽样）胞苷脱氨酶和 DBAC（二苯并[a,j]吖啶）特征与年轻患者中显著升高的激素生物合成和化学致癌作用联系起来，并识别出一个具有高突变负荷和免疫逃逸的新亚群，可能获益……（更多内容见 dbGaP 研究页面。）
【主题与分类】
主题标签：PRJNA909918、ACADEMIA SINICA。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP423793
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP423793
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
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