整合组学检测发热性中性粒细胞减少症患者菌血症
Wenjing Peng，整合转录组学、蛋白质组学与糖组学以深入洞察乳腺癌脑转移机制：强调糖基化作用 [数据集]。主题标签：发热性中性粒细胞减少症、菌血症、整合组学、转录组学、蛋白质组学、糖组学、乳腺癌脑转移
基本信息
资源简介
整合组学检测发热性中性粒细胞减少症患者菌血症
该数据集英文名为 Integrative omics to detect bacteremia in patients with febrile neutropenia，在来源站点 ebi.ac.uk 上被归类于肿瘤 / 乳腺癌方向。从名称看，其关注点在于以整合组学手段检测发热性中性粒细胞减少症患者的菌血症；而来源站给出的描述则指向 Wenjing Peng 关于整合转录组学、蛋白质组学与糖组学以深入洞察乳腺癌脑转移机制、强调糖基化作用的研究数据集（PXD010506）。相关主题标签涵盖发热性中性粒细胞减少症、菌血症、整合组学、转录组学、蛋白质组学、糖组学以及乳腺癌脑转移。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍，凡未覆盖之处均如实标注。
【数据集背景】
该数据集在来源站点上归属于肿瘤 / 乳腺癌分类，其英文名称所表达的主题是：利用整合组学方法检测发热性中性粒细胞减少症患者的菌血症。发热性中性粒细胞减少症是肿瘤患者接受强化治疗后常见的临床情形，菌血症的识别在该人群中具有重要的临床意义，整合组学则意味着联合多层次的分子测量来寻找可判别感染的信号。与此同时，来源站提供的描述指向另一条研究线索，即整合转录组学、蛋白质组学与糖组学以深入洞察乳腺癌脑转移机制，并强调糖基化作用。两条线索共同构成本数据集在来源站上的背景信息。
【数据内容】
依据来源站描述，该数据集对应 Wenjing Peng 的研究工作，其内容框架为整合转录组学、蛋白质组学与糖组学三个层面，用以深入洞察乳腺癌脑转移的机制，并特别强调糖基化在其中的作用。主题标签进一步列出了发热性中性粒细胞减少症、菌血症、整合组学、转录组学、蛋白质组学、糖组学与乳腺癌脑转移等关键词。关于具体的样本数量、组学数据文件类型、鉴定到的分子数目等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，来源站给出的项目标识为 PXD010506，可通过 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010506 访问。数据集英文名称与来源站描述分别指向发热性中性粒细胞减少症菌血症检测与乳腺癌脑转移机制研究两个主题。关于样本采集地点、采集时间、受试者来源与伦理审批等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于名称与主题标签，该数据集可能适用于以下方向：在发热性中性粒细胞减少症患者中探索以整合组学信号识别菌血症的研究；乳腺癌脑转移机制研究，尤其是糖基化相关机制的分析；以及转录组学、蛋白质组学与糖组学多层面数据的整合分析实践。需要说明的是，上述场景系依据数据集名称与主题标签所作的领域层面归纳，具体适用性需以数据实际内容为准；关于数据是否可直接用于临床诊断模型构建等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站给出的项目页面链接获取。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤、分析流程与配套工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集在来源站上的分类为肿瘤 / 乳腺癌，而其英文名称指向发热性中性粒细胞减少症患者的菌血症检测，来源站描述则指向乳腺癌脑转移的整合组学研究，三者之间的对应关系需使用者自行核对。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应与样本量等，源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参考来源站描述中给出的文献信息：Wenjing Peng, Integrated Transcriptomics, Proteomics and Glycomics for a Deeper Insight of the Mechanism of Breast Cancer Brain Metastasis: Emphasizing on Glycosylation [Dataset]，项目编号 PXD010506。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010506
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
彭文静，整合转录组学、蛋白质组学和糖组学以深入探究乳腺癌脑转移机制：重点探讨糖基化[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010506
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
