IDC 小鼠乳腺数据集

该数据集为 IDC 收集的小鼠乳腺磁共振成像数据,包含 32 只小鼠的乳腺肿瘤 MRI 影像,肿瘤位于腹部,癌症类型为乳腺癌

idc
浏览 21
医学影像分类Breast CancerAbdomen
IDC Mouse-Mammary

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

IDC 小鼠乳腺数据集

IDC Mouse-Mammary 是一个专注于小鼠乳腺癌的磁共振成像数据集,归属于肿瘤与乳腺癌分类。该数据集来源于 portal.imaging.datacommons.cancer.gov,共包含 32 只小鼠的乳腺肿瘤 MRI 影像。其癌症类型为乳腺癌,肿瘤位置位于腹部。数据集以小鼠为研究对象,通过磁共振成像技术获取乳腺肿瘤的影像资料,为乳腺癌的临床前研究提供了影像学基础。该数据集在 IDC 平台上的主题标签为 Breast Cancer 和 Abdomen,便于用户按癌症类型和解剖部位进行检索与筛选。整体而言,该数据集规模适中,聚焦于特定动物模型的乳腺肿瘤成像,适合用于方法验证、影像分析流程测试以及临床前肿瘤影像研究。

【数据集背景】

乳腺癌是严重威胁人类健康的恶性肿瘤之一,临床前动物模型在乳腺癌发病机制、肿瘤生长监测以及治疗反应评估中具有重要作用。小鼠乳腺肿瘤模型因其与人类乳腺癌在组织学和分子特征上的相似性,被广泛用于肿瘤生物学和影像学研究。IDC Mouse-Mammary 数据集正是在这一背景下建立,旨在通过磁共振成像技术对小鼠乳腺肿瘤进行无创、可重复的影像采集,为研究者提供标准化的临床前影像数据。该数据集所属的 IDC(Imaging Data Commons)平台致力于整合和共享癌症影像数据,促进影像数据的可查找、可访问、可互操作和可重用。该数据集的建立有助于推动乳腺癌临床前影像研究的发展,并为影像分析方法在动物模型上的验证提供数据支持。

【数据内容】

该数据集包含 32 只小鼠的乳腺肿瘤磁共振成像(MRI)影像。癌症类型为乳腺癌,肿瘤位置位于腹部。数据集的主题标签为 Breast Cancer 和 Abdomen,反映了其核心内容聚焦于腹部区域的乳腺肿瘤影像。每只小鼠的影像数据均以 MRI 模态采集,能够提供软组织对比度较高的图像,适用于观察肿瘤的形态、大小及位置等特征。数据集中包含的影像数量、具体序列参数、图像分辨率、层厚、扫描范围等详细信息,源站未提供。此外,关于肿瘤的具体病理类型、分级、分子分型以及每只小鼠的个体信息(如年龄、体重、品系等),源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 portal.imaging.datacommons.cancer.gov,属于 IDC 平台中的 Mouse-Mammary 集合。根据源站描述,该集合由 32 只小鼠的乳腺肿瘤 MRI 影像组成。源站还提供了 Mouse-Mammary 的 wiki 页面(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2015.9P42KSE6),用户可通过该页面了解更多关于图像的信息并获取该集合的支持性元数据。关于具体的采集设备、扫描参数、成像协议、采集时间、麻醉方式、对比剂使用情况等细节,源站未提供。数据集的原始来源机构、伦理审批信息以及数据共享协议的具体条款,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌临床前影像研究的相关场景。由于包含小鼠乳腺肿瘤的 MRI 影像,可用于开发和验证针对动物模型的肿瘤分割、检测和定量分析方法。研究者可利用该数据集进行影像组学特征提取、肿瘤生长监测、治疗反应评估等研究。此外,该数据集还可用于机器学习模型的训练与测试,尤其是在小样本、特定解剖部位(腹部)的影像分析任务中。对于希望将临床前影像与临床影像进行对比研究的人员,该数据集也可作为参考数据。然而,由于数据集仅包含 32 只小鼠的影像,且源站未提供详细的病理和分子信息,其适用范围可能受限于特定研究目的。具体的使用场景需结合用户自身的研究问题和数据可获取的元数据来判断。

【使用方法】

用户可通过 portal.imaging.datacommons.cancer.gov 访问该数据集。源站提供了 Mouse-Mammary 的 wiki 页面(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2015.9P42KSE6),用户可访问该页面以了解图像详情并获取支持性元数据。关于数据的具体下载方式、文件格式、数据组织结构和访问权限,源站未提供。用户在使用前应仔细阅读源站提供的相关说明和元数据,以确保正确理解和使用数据。对于需要批量处理或集成分析的用户,建议参考 IDC 平台提供的通用工具和接口。由于源站未提供详细的使用指南,用户可能需要自行探索数据的具体组织方式。

【质量与限制】

该数据集包含 32 只小鼠的乳腺肿瘤 MRI 影像,样本量相对有限,可能影响统计分析的效力。源站未提供关于图像质量、扫描参数一致性、伪影情况、信噪比等质量指标的信息。此外,源站未提供肿瘤的病理验证信息、分子分型、分级以及每只小鼠的个体特征,这可能限制数据在特定研究中的应用。数据集仅涵盖乳腺癌且肿瘤位于腹部,未包含其他癌症类型或解剖部位,因此其代表性有限。用户在使用时应注意这些限制,并结合自身研究目的评估数据的适用性。关于数据的标注信息、分割掩膜、随访数据等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的源站描述中提供了 Mouse-Mammary 的 wiki 页面链接(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2015.9P42KSE6),用户可通过该链接获取更多信息。关于该数据集的具体引用格式、许可协议、使用条款以及数据共享政策,源站未提供。用户在使用该数据集时,应遵循源站及 IDC 平台的相关规定,并建议引用源站提供的 DOI 或相关文献。由于源站未明确说明许可信息,用户在使用前应自行确认数据的使用权限和限制。

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使用方式

数据集获取

源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=mouse_mammary

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDC收集小鼠乳腺。癌症类型:乳腺癌。肿瘤位置:腹部。受试者:32只。本收集包含32只小鼠的乳腺癌磁共振成像(MRI)。请参阅小鼠乳腺(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2015.9P42KSE6)wiki页面,以了解更多关于这些图像的信息并获取此收集的任何支持元数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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