人乳腺癌原位捕获转录组学数据
该数据集来自 data.mendeley.com，包含 23 例乳腺癌患者的原位捕获转录组学数据，覆盖 luminal A、luminal B、三阴性和 HER2 阳性四种亚型，每例设三个重复
基本信息
资源简介
人乳腺癌原位捕获转录组学数据
Human breast cancer in situ capturing transcriptomics
该数据集来自 data.mendeley.com，包含 23 例乳腺癌患者的原位捕获转录组学数据，覆盖 luminal A、luminal B、三阴性和 HER2 阳性四种亚型，每例设三个重复。数据共 273 个文件，包含坐标文件与表达数据文件，并附有肿瘤注释文件。可用于研究不同乳腺癌亚型的空间转录组特征，支持亚型分类、基因表达分析及肿瘤区域注释等任务（来源 Mendeley Data）。
【数据集背景】
源站首次发布：2021-11-30。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：来自 23 例 luminal A、luminal B、三阴性和 HER2 阳性亚型乳腺癌患者的三个重复样本。患者、重复和亚型关联请参考 metadata.csv。所有样本均使用 [1] 中描述的协议生成。[1]: 版本 4 和 5 的变更：- 尝试修复顺序错误的贡献者列表 版本 3 的变更：- 添加了肿瘤注释文件 版本 2 的变更：- 为 spot 文件添加了索引 - 删除了 spot 数据不良的样本（23901_C1）
【数据结构与技术规格】
文件数 273 个，合计 758.21 MB。数据集 DOI：10.17632/29ntw7sh4r.5。
【主题与分类】
主题标签：乳腺癌、转录组学、空间转录组、肿瘤亚型、原位捕获、HER2阳性、三阴性。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/29ntw7sh4r
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/29ntw7sh4r
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 758.2 MB。
数据说明
Linnea Stenbeck (2021). Human breast cancer in situ capturing transcriptomics [Dataset]. http://doi.org/10.17632/29ntw7sh4r.5
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
