NCBI GEO 的 GSE25066 原始数据层
该 SuperSeries 由以下子系列组成：GSE25055：乳腺癌新辅助紫杉烷-蒽环类化疗后反应与生存基因组预测的发现队列；GSE25065：基因组预测的验证队列
基本信息
资源简介
NCBI GEO 的 GSE25066 原始数据层
GSE25066 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries，其原始数据层由两个子系列构成：GSE25055 与 GSE25065。该数据集在本地分类中归入肿瘤 / 乳腺癌方向，来源站为 synapse.org。按照源站描述，这一 SuperSeries 汇集了围绕乳腺癌新辅助紫杉烷-蒽环类化疗后反应与生存基因组预测所建立的发现队列与验证队列，前者对应 GSE25055，后者对应 GSE25065。整体来看，该数据集的组织方式强调以 SuperSeries 统合子系列，从而把发现与验证两个阶段的数据纳入同一框架之下，便于围绕同一研究主题进行联合查阅与对照使用。
【数据集背景】
该数据集面向乳腺癌新辅助化疗场景下的基因组预测研究。源站描述明确指出，其子系列 GSE25055 是“乳腺癌新辅助紫杉烷-蒽环类化疗后反应与生存基因组预测的发现队列”，GSE25065 则是“基因组预测的验证队列”。由此可知，该 SuperSeries 的设立与“反应与生存”的基因组预测这一研究目标直接相关，并通过发现队列与验证队列的分工来组织数据。本站将其归类为肿瘤 / 乳腺癌，进一步表明其所属的疾病领域。
【数据内容】
该数据集为 SuperSeries 结构，由 GSE25055 和 GSE25065 两个子系列组成。源站描述对两个子系列的定位分别为发现队列和验证队列，均围绕乳腺癌新辅助紫杉烷-蒽环类化疗后的反应与生存基因组预测。除上述子系列构成与各自定位外，源站未提供关于样本数量、平台类型、数据文件格式、临床变量字段等更细的内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO，并在 synapse.org 上提供。其英文名称为“GSE25066 Raw Data Layer from NCBI GEO”，表明所涉及的是该 SuperSeries 的原始数据层。源站描述说明了 SuperSeries 与子系列之间的组成关系，即由 GSE25055 与 GSE25065 两个子系列构成。关于样本采集地点、时间范围、伦理审批与知情同意等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集适用于围绕乳腺癌新辅助紫杉烷-蒽环类化疗后反应与生存的基因组预测研究，尤其适合在“发现—验证”框架下使用：GSE25055 可作为发现队列，GSE25065 可作为验证队列。本站的肿瘤 / 乳腺癌分类也提示其可用于乳腺癌相关肿瘤研究的数据查阅与对照。关于其他具体适用场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 SuperSeries 形式组织，使用时可按子系列分别获取 GSE25055 与 GSE25065 的数据，并依据发现队列与验证队列的定位进行分组分析或对照分析。由于名称为“Raw Data Layer”，使用时应关注原始数据层这一层级。关于具体的下载方式、文件组织、预处理步骤与分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
源站描述仅说明了 SuperSeries 的组成及两个子系列的队列定位，未提供样本量、数据完整性、批次效应、缺失值处理等质量相关信息，也未提供使用限制说明。因此，关于该数据集的质量评价与限制条件，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://synapse.org/Synapse:syn236431
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本超级系列由以下子系列组成：GSE25055：乳腺癌新辅助紫杉烷-蒽环类化疗后反应和生存基因组预测指标的发现队列；GSE25065：基因组预测指标的验证队列。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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