转移性乳腺癌患者生殖系多态性预测与预后价值评估

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01460186

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：乳腺癌、转移。StoRM试验旨在与SIGNAL研究联合分析，后者致力于解析HER2基因扩增乳腺癌的遗传风险及其对辅助治疗的耐药性或毒性。SIGNAL研究正在招募6000例局限性乳腺癌患者。StoRM试验的目的是建立一个包含1500例转移性乳腺癌患者的队列，包括详细的流行病学与治疗数据。利用这些患者的胚系多态性，并将其与SIGNAL研究中的局限性癌症患者进行比较，研究者将回答关于遗传对乳腺癌预后及其转移阶段治疗反应影响的具体问题。在知情同意并纳入研究后，将采集血液样本，分别置于一支6 ml EDTA管和一支6 ml ACD管中。为简化研究进展并避免混淆，所遵循的样本采集程序将与SIGNAL研究中使用的程序完全相同。

当样本送达生物资源中心后，血浆将被分装至500微升管中，并于-80°C下冷冻保存。DNA将采用标准方案进行提取。血浆与DNA将被储存以备遗传分析之用。DNA样本的一份分装将针对覆盖全基因组的高密度遗传标记 panel 进行基因分型，用于全基因组关联研究。所采集的血浆亦可用于分析以确定蛋白质的表达谱，单独分析或结合遗传因素，从而区分不同的患者群体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。