ELP3敲低与对照的BT549细胞表达数据

该数据集来自 EBI 的 Expression Atlas,为差异表达实验,物种为 Homo sapiens,比较 BT549 细胞中 ELP3 敲低组与对照组

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基因组回归Differential
E-MTAB-9206: BT549 cells depleted of ELP3 compared to control

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

ELP3敲低与对照的BT549细胞表达数据

E-MTAB-9206 是一个来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,全称为“BT549 cells depleted of ELP3 compared to control”。该数据集以人类(Homo sapiens)为物种,围绕乳腺癌细胞系 BT549 展开,比较 ELP3 敲低组与对照组之间的基因表达差异。数据集在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 Differential,即差异表达。整体而言,该数据集提供了一个在特定乳腺癌细胞背景下研究 ELP3 功能缺失所引发转录变化的实验资源,适合用于差异表达结果查阅以及相关基因表达变化的初步探索。

【数据集背景】

该数据集来源于 EBI 的 Expression Atlas,属于其中的差异表达实验(Differential)类型。实验的核心设计是比较 BT549 细胞中 ELP3 被敲低后与对照组之间的表达差异。BT549 为乳腺癌相关细胞系,因此该实验置于肿瘤 / 乳腺癌的研究分类之下。ELP3 作为被干预的目标,其缺失所导致的表达谱变化是该实验关注的焦点。源站描述仅给出了实验名称、物种与比较设计,未提供更多关于研究动机、疾病背景或生物学假设的说明。

【数据内容】

数据集的内容为差异表达实验结果,物种为 Homo sapiens,实验体系为 BT549 细胞,分组为 ELP3 敲低组与对照组。主题标签为 Differential,表明数据以两组之间的表达差异为核心。源站未提供具体的差异基因数量、表达倍数、显著性阈值、检测平台、样本数量或数据文件格式等细节。

【采集与来源】

该数据集来自 ebi.ac.uk,即 EBI 的 Expression Atlas 实验条目,源站描述明确其为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens,实验名称为 BT549 cells depleted of ELP3 compared to control。除来源站与实验类型外,源站未提供样本采集、处理流程、测序或芯片平台等具体信息。

【适用场景】

基于其差异表达实验的性质,该数据集可用于查阅 BT549 细胞中 ELP3 敲低相对于对照组的表达变化结果,并可作为乳腺癌细胞背景下 ELP3 相关表达研究的参考资源。由于分类为肿瘤 / 乳腺癌,其适用场景与乳腺癌相关的基因表达差异分析相契合。源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

源站未提供。该数据集在 Expression Atlas 中的具体访问方式、检索入口、下载途径与分析操作说明均未给出。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、重复数、统计方法或技术验证的信息。可确认的限制是:该数据集仅涉及 BT549 单一细胞系背景下的 ELP3 敲低与对照比较,源站描述未提及其他细胞系、其他物种或体内实验。其余质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-9206

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. BT549 cells depleted of ELP3 compared to control

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