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创建/更新时间

2026-11-03

资源简介

E-MTAB-6120：乳腺癌中ERalfa对脂联素暴露下LKB1/AMPK相互作用的影响

E-MTAB-6120 是一个围绕乳腺癌中信号调控机制展开的基因表达差异分析数据集，其英文全称为“Uncoupling effects of ERalfa on LKB1/AMPK interaction upon adiponectin exposure in breast cancer”。该数据集归属于肿瘤 / 乳腺癌类别，来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas 中的 Differential 实验。整体来看，该数据集聚焦于乳腺癌相关基因表达差异分析场景，可用于研究 ERalfa 与 LKB1/AMPK 信号通路在脂联素作用下的调控关系，并支持差异表达比较与后续生物信息学分析。其主题标签为 Differential，说明该数据以差异表达分析为核心特征，适合用于比较不同实验条件下的基因表达变化，并围绕乳腺癌中 ERalfa、LKB1/AMPK 以及脂联素暴露之间的相互作用开展探索性研究。

【数据集背景】

该数据集来自 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas experiment (Differential)。其物种为 Homo sapiens。研究主题围绕乳腺癌展开，英文名称明确指出其关注“Uncoupling effects of ERalfa on LKB1/AMPK interaction upon adiponectin exposure in breast cancer”。从这一标题可以看出，数据集所对应的研究背景涉及乳腺癌中 ERalfa 对 LKB1/AMPK 相互作用的解偶联效应，并且与脂联素暴露条件相关。本站分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为 Differential，表明该数据在肿瘤学尤其是乳腺癌研究领域中，以差异表达实验的形式提供信息。源站描述同时给出了物种、实验类型和标题信息，未提供更多关于实验设计、样本数量、处理条件或具体分析结果的细节。

【数据内容】

该数据集属于 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens，主题标签为 Differential。其内容围绕乳腺癌相关基因表达差异分析场景展开，可用于研究 ERalfa 与 LKB1/AMPK 信号通路在脂联素作用下的调控关系，并支持差异表达比较与后续生物信息学分析。数据集的英文标题进一步说明其关注 ERalfa 在脂联素暴露条件下对 LKB1/AMPK 相互作用的解偶联效应。除上述信息外，关于具体基因列表、表达矩阵、差异倍数、显著性指标、样本分组、重复数量等内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas experiment (Differential)。源站描述指出其物种为 Homo sapiens，并给出了实验标题“Uncoupling effects of ERalfa on LKB1/AMPK interaction upon adiponectin exposure in breast cancer”。本站分类为肿瘤 / 乳腺癌，主题标签为 Differential。关于样本采集方式、实验平台、测序或芯片类型、数据处理流程、原始数据文件格式、伦理审批信息等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌相关基因表达差异分析场景，可用于研究 ERalfa 与 LKB1/AMPK 信号通路在脂联素作用下的调控关系，并支持差异表达比较与后续生物信息学分析。由于主题标签为 Differential，其典型用途包括围绕不同实验条件进行差异表达比较，以及在此基础上开展通路层面的探索。该数据集的标题和来源信息表明，其可能服务于乳腺癌中 ERalfa、LKB1/AMPK 与脂联素暴露之间关系的研究。但关于具体适用分析类型、可支持的统计方法、是否适合特定平台或特定疾病亚型，源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas experiment (Differential)。用户可通过来源站获取该实验相关信息。关于下载方式、文件结构、数据格式、预处理步骤、标准化方法、分析工具推荐、代码示例或操作流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens，主题标签为 Differential，来源站为 ebi.ac.uk。其标题和源站描述提供了研究主题和实验类型信息。关于数据质量评估、批次效应、样本量、重复性、缺失值情况、覆盖度、验证状态、版本更新记录以及使用限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas experiment (Differential)。关于引用格式、作者列表、发表文献、许可协议、使用条款、再分发限制或商业使用规定，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-6120

访问原始数据

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数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-6120

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Uncoupling effects of ERalfa on LKB1/AMPK interaction upon adiponectin exposure in breast cancer

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别