E-GEOD-16873:乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,主题为乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调

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基因组分类Differential
E-GEOD-16873: Early Dysregulation of Cell Adhesion and Extracellular Matrix Pathways in Breast Cancer Progression

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

E-GEOD-16873:乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调

E-GEOD-16873 是一个聚焦乳腺癌进展机制的基因表达数据集,英文全称为 Early Dysregulation of Cell Adhesion and Extracellular Matrix Pathways in Breast Cancer Progression,即“乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调”。该数据集收录于 EBI Expression Atlas,属于差异表达实验,研究物种为 Homo sapiens(人类),在分类上归入肿瘤 / 乳腺癌方向。从主题上看,它围绕乳腺癌进展过程中细胞黏附与细胞外基质通路在早期阶段发生的异常调控展开,适合用于考察肿瘤演进相关通路在转录层面的变化特征。整体而言,该数据集为研究乳腺癌早期进展的分子机制提供了一个以差异表达为核心的组织化数据资源。

【数据集背景】

乳腺癌的进展涉及肿瘤细胞与周围微环境之间相互作用的持续改变,细胞黏附与细胞外基质通路在这一过程中扮演重要角色。该数据集正是以“乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调”为主题,来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为人类。其命名直接点明了研究关注的核心问题,即上述通路在乳腺癌进展早期阶段出现的表达失调现象。

【数据内容】

该数据集属于差异表达(Differential)类型的表达实验数据,主题标签为 Differential。源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。数据内容围绕乳腺癌进展过程中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调这一主题组织,具体包含的样本数量、分组方式、检测平台、基因数量及差异表达阈值等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即 EBI Expression Atlas 中的一项差异表达实验。源站描述明确给出物种为 Homo sapiens,实验主题为乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路的早期失调。除来源站与实验类型外,关于样本采集地点、时间跨度、伦理审批及原始数据提交信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与实验类型,该数据集可用于关注乳腺癌进展早期分子变化的分析场景,例如考察细胞黏附与细胞外基质相关通路在疾病进展中的表达差异,或作为差异表达结果用于通路层面的解读与比较研究。由于其为差异表达实验,也适合用于验证与乳腺癌进展相关的候选通路假设。具体适用的分析流程与统计方法,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 EBI Expression Atlas 获取,属于该平台组织呈现的差异表达实验。使用时应以其差异表达主题为出发点,结合乳腺癌进展中细胞黏附与细胞外基质通路早期失调这一研究背景进行解读。关于数据下载格式、分析工具、参数设置及复现步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,属于差异表达实验,物种为人类,主题明确。关于数据质量评估指标、样本量、批次效应处理、验证实验及结果置信度等信息,源站未提供。使用时应注意其差异表达实验的定位,不宜将其直接等同于完整的机制结论。

【引用与许可】

该数据集英文名称为 E-GEOD-16873: Early Dysregulation of Cell Adhesion and Extracellular Matrix Pathways in Breast Cancer Progression,来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用文献、作者列表、许可协议及使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-16873

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Early Dysregulation of Cell Adhesion and Extracellular Matrix Pathways in Breast Cancer Progression

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