体外乳腺癌克隆间合作中弱转移克隆旁分泌介导共选的可治疗靶向通路数据集

用于MCF7迁移的数据集,处理条件为MDA CM联合抑制剂(图5-7)、转录组学分析(图1-3)及补充材料。主题标签:乳腺癌、MCF7、MDA CM、转录组学、细胞迁移、抑制剂、克隆间合作

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时间序列分类乳腺癌MCF7MDA CM转录组学细胞迁移抑制剂克隆间合作
Dataset for Therapeutically targetable pathways underlying  the paracrine-mediated co-option of a weakly metastatic clone in an in vitro breast cancer model of inter-clonal cooperation

基本信息

模态
时间序列
大小
0.018178924 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

体外乳腺癌克隆间合作中弱转移克隆旁分泌介导共选的可治疗靶向通路数据集

该数据集围绕体外乳腺癌模型中克隆间合作现象展开,聚焦于弱转移性克隆如何通过旁分泌机制被共选,以及其中可治疗性靶向通路的探索。数据集英文名称为“Dataset for Therapeutically targetable pathways underlying the paracrine-mediated co-option of a weakly metastatic clone in an in vitro breast cancer model of inter-clonal cooperation”,由Soares Carneiro, Caroline与Nedelcu, Aurora Mihaela共同贡献,发布于Zenodo平台,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。数据集内容涵盖MCF7细胞在MDA条件培养基(MDA CM)联合抑制剂处理下的迁移实验数据(对应图5至图7)、转录组学分析数据(对应图1至图3)以及补充材料,属于肿瘤/乳腺癌研究领域,涉及乳腺癌、MCF7、MDA CM、转录组学、细胞迁移、抑制剂及克隆间合作等主题。

【数据集背景】

该数据集来源于一项针对体外乳腺癌模型中克隆间合作机制的研究。研究关注弱转移性克隆在肿瘤群体中如何通过旁分泌信号被其他克隆“共选”,从而获得更强的迁移或转移能力。这一过程可能涉及可被治疗性靶向的信号通路。数据集标题明确指向“therapeutically targetable pathways”,说明其目标是为识别潜在干预靶点提供实验依据。研究使用MCF7细胞作为模型,并以MDA条件培养基(MDA CM)作为旁分泌刺激来源,同时引入抑制剂以解析特定通路的作用。该数据集发布于Zenodo,属于开放获取资源,供乳腺癌研究领域的研究者使用。

【数据内容】

数据集包含三类主要材料:第一,MCF7细胞迁移实验数据,处理条件为MDA CM联合抑制剂,对应图5至图7;第二,转录组学分析数据,对应图1至图3;第三,补充材料。这些数据共同支持对旁分泌介导的克隆间合作及其可靶向通路的分析。迁移实验数据可能反映不同抑制剂对MDA CM诱导的MCF7迁移能力的影响,而转录组学数据则可能揭示相关基因表达变化或通路富集情况。补充材料可能包含额外的实验细节、重复数据或辅助图表。源站描述仅列出上述范围,未提供更具体的样本数量、时间点、抑制剂种类或测序平台等信息。

【采集与来源】

数据集来源站为doi.org,发布机构为Zenodo。作者为Soares Carneiro, Caroline和Nedelcu, Aurora Mihaela。发布时间为2026年。源站描述指出,数据集用于MCF7迁移实验(MDA CM联合抑制剂,图5-7)、转录组学分析(图1-3)及补充材料。关于细胞培养条件、MDA CM制备方法、抑制剂浓度、迁移实验具体操作、转录组学建库与测序细节、数据分析流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌基础研究,尤其是关注肿瘤克隆间合作、旁分泌信号、细胞迁移及治疗靶点发现的研究方向。具体而言,可用于分析MDA CM如何影响MCF7细胞的迁移行为,以及不同抑制剂对该过程的干预效果;也可用于转录组学层面的差异表达分析、通路富集分析或与迁移表型的关联研究。此外,该数据集可能适合作为方法学参考,用于设计类似的体外共培养或条件培养基实验。由于涉及“therapeutically targetable pathways”,它也可能服务于药物靶点筛选或验证的早期研究。源站未提供具体适用场景的进一步说明。

【使用方法】

使用者可通过doi.org访问该数据集,并依据Creative Commons Attribution 4.0 International许可进行使用。使用时应结合图1至图3的转录组学数据与图5至图7的迁移实验数据,以及补充材料,进行整合分析。具体分析方式可能包括:比较不同处理组间的迁移差异、识别转录组变化、探索候选通路与迁移表型的关联。由于源站未提供详细的数据结构、文件格式或分析代码,使用者可能需要参考原始论文或补充材料以获取实验设计细节。源站未提供推荐的分析工具或流程。

【质量与限制】

该数据集发布于Zenodo,采用开放许可,具备可引用性和可获取性。然而,源站未提供关于数据质量评估、重复次数、统计功效、技术验证或潜在偏倚的信息。数据集基于体外乳腺癌模型,使用MCF7细胞和MDA CM,其结果外推到体内或临床情境需谨慎。此外,源站未提供样本量、抑制剂特异性、转录组学深度或数据完整性等关键参数。因此,使用者在解释结果时应考虑这些限制。源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,允许在署名原作者的前提下共享、改编和商业使用。引用时需注明数据集英文名称、作者Soares Carneiro, Caroline与Nedelcu, Aurora Mihaela、发布机构Zenodo、发布时间2026年及来源站doi.org。源站未提供具体的引用格式或DOI编号。使用者应遵守许可条款,确保适当署名。源站未提供其他引用与许可细节。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.20511051

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 18.2 MB。

数据说明

用于MCF7在MDA条件培养基联合抑制剂处理下迁移的数据集(图5-7)、转录组学分析(图1-3)及补充材料

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