男性乳腺癌单细胞测序数据

数据可用于男性乳腺癌单细胞层面的表达分析,并可与女性乳腺癌进行人群比较研究(来源 Mendeley Data)。男性乳腺癌的单细胞测序数据

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2026-05-09 更新
浏览 5
基因组分类男性乳腺癌单细胞测序乳腺癌肿瘤全国人群比较
Data from: Male breast cancer: a nation-wide population-based comparison with female breast cancer

基本信息

模态
基因组
大小
1.096942555 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-05-09
版本
v1

资源简介

男性乳腺癌单细胞测序数据

该数据集为男性乳腺癌单细胞测序数据,英文名称为“Data from: Male breast cancer: a nation-wide population-based comparison with female breast cancer”,源站标题为“Single-cell sequencing data of male breast cancer”,由 Mendeley Data 平台发布,DOI 为 10.17632/5wc254mzxs.1,版本为 v1,发布时间为 2026-05-09。数据集共包含 3 个文件,分别为 barcodes.csv.gz、counts.mtx.gz 和 genes.csv.gz,合计约 1.10 GB,均以 GZIP 压缩格式提供。该数据可用于男性乳腺癌单细胞层面的表达分析,并支持与女性乳腺癌开展人群比较研究,属于肿瘤/乳腺癌分类下的单细胞测序资源。

【数据集背景】

男性乳腺癌是一种相对少见的乳腺恶性肿瘤,针对其单细胞层面的研究数据较为有限。该数据集以男性乳腺癌为对象,提供单细胞测序数据,其英文名称同时指向一项全国性、基于人群的男性乳腺癌与女性乳腺癌比较研究,说明该数据在设计意图上兼顾男性乳腺癌的单细胞表达特征刻画与两性乳腺癌的人群比较分析。数据集由 Mendeley Data 平台发布,采用 DOI 标识,便于在学术研究中稳定引用与追溯。

【数据内容】

数据集共包含 3 个文件,分别为 barcodes.csv.gz、counts.mtx.gz 和 genes.csv.gz,合计 1.10 GB。从文件构成看,barcodes.csv.gz 与 genes.csv.gz 分别对应细胞条形码与基因注释信息,counts.mtx.gz 对应表达计数矩阵,三者共同构成单细胞表达分析所需的基础文件组合。所有文件均以 GZIP 压缩格式提供,使用前需按相应格式解压读取。源站未提供样本数量、细胞数目、基因数目、测序平台及测序深度等具体参数。

【采集与来源】

该数据集来源于 data.mendeley.com,源站标题为“Single-cell sequencing data of male breast cancer”,源站描述与标题一致。数据集发布时间为 2026-05-09,版本为 v1,DOI 为 10.17632/5wc254mzxs.1。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序平台与建库方法等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据适用于男性乳腺癌单细胞层面的表达分析,可用于在单细胞分辨率下考察男性乳腺癌的细胞组成与基因表达特征;同时,结合其与女性乳腺癌进行人群比较的研究定位,该数据也可用于两性乳腺癌之间的比较研究。此外,该数据可作为单细胞表达分析流程的输入数据,用于细胞聚类、基因表达定量等通用分析环节。源站未提供具体的分析结论或验证结果。

【使用方法】

使用该数据集时,需先下载全部 3 个文件,即 barcodes.csv.gz、counts.mtx.gz 和 genes.csv.gz,合计 1.10 GB,并按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入完整数据,以避免因格式或编码问题导致批量处理出错。读取后的条形码、基因注释与计数矩阵可配合常规单细胞分析工具使用。源站未提供具体的软件版本、参数设置或代码示例。

【质量与限制】

该数据集以 GZIP 压缩格式提供,文件数量为 3 个,版本为 v1,具备 DOI 标识。源站未提供数据质量评估报告、缺失值情况、批次效应信息、样本量说明及适用范围限制等内容,使用者在分析前应自行核对数据完整性与字段编码。由于源站未提供测序平台、样本来源与伦理信息,相关方法学细节无法从现有信息中确认。

【引用与许可】

引用该数据集时,可使用其 DOI:10.17632/5wc254mzxs.1,并注明数据集英文名称“Data from: Male breast cancer: a nation-wide population-based comparison with female breast cancer”、版本 v1 及发布平台 Mendeley Data。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://data.mendeley.com/datasets/5wc254mzxs

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.10 GB。

数据说明

Huan Lin (2026). Single-cell sequencing data of male breast cancer [Dataset]. http://doi.org/10.17632/5wc254mzxs.1

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