男性乳腺癌无标记定量蛋白质组学与生物信息学整合分析数据

男性乳腺癌中无标记定量蛋白质组学与生物信息学整合分析揭示信号通路见解 [数据集]。主题标签:男性乳腺癌、蛋白质组学、无标记定量、生物信息学、信号通路、肿瘤

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时间序列分类男性乳腺癌蛋白质组学无标记定量生物信息学信号通路肿瘤
Data from: Integrated analysis of label-free quantitative proteomics and bioinformatics reveal insights into signaling pathways in male breast cancer

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

男性乳腺癌无标记定量蛋白质组学与生物信息学整合分析数据

该数据集英文名为 Data from: Integrated analysis of label-free quantitative proteomics and bioinformatics reveal insights into signaling pathways in male breast cancer,属于肿瘤 / 乳腺癌分类,来源于 ebi.ac.uk。源站描述为 Michel Batista(2021)发布的“Integrated analysis of label-free quantitative proteomics and bioinformatics reveal insights into signaling pathways in male breast cancer”数据集,项目编号为 PXD012453。该数据集围绕男性乳腺癌展开,采用无标记定量蛋白质组学与生物信息学整合分析,旨在揭示与男性乳腺癌相关的信号通路见解。其主题标签涵盖男性乳腺癌、蛋白质组学、无标记定量、生物信息学、信号通路与肿瘤,适合关注男性乳腺癌分子机制及蛋白质组学研究的用户参考使用。

【数据集背景】

男性乳腺癌是一种相对少见的乳腺癌类型,其分子机制与女性乳腺癌存在差异,相关研究数据较为有限。该数据集以男性乳腺癌为研究对象,通过无标记定量蛋白质组学与生物信息学整合分析,探索该疾病中的信号通路特征。数据集由 Michel Batista 于 2021 年发布,收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE Archive,项目编号为 PXD012453。其核心目标是为理解男性乳腺癌的蛋白质组学特征及潜在信号通路提供数据基础。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括男性乳腺癌、蛋白质组学、无标记定量、生物信息学、信号通路与肿瘤。从名称与描述可知,数据内容涉及无标记定量蛋白质组学数据,并结合生物信息学分析以揭示男性乳腺癌中的信号通路见解。关于具体样本数量、蛋白质鉴定数量、定量结果文件类型、分析结果表格等详细内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中标注的发布者为 Michel Batista,发布年份为 2021,项目编号为 PXD012453。数据通过无标记定量蛋白质组学技术路线获取,并在此基础上开展生物信息学整合分析。关于样本采集地点、样本来源机构、实验仪器型号、色谱与质谱参数等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于男性乳腺癌相关的基础与转化研究场景,例如蛋白质组学层面的差异分析、信号通路层面的探索性研究,以及与其他乳腺癌蛋白质组学数据的比较分析。其主题标签中的无标记定量与生物信息学也表明,该数据可用于方法学参考或整合分析流程的验证。关于具体的适用疾病亚型、临床分层或验证实验设计,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以项目编号 PXD012453 收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE Archive,用户可依据该编号在源站检索并获取数据。使用时建议结合无标记定量蛋白质组学的常规分析流程,并配合生物信息学方法进行信号通路层面的解读。关于数据文件的具体格式、下载方式、分析软件推荐及参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 Michel Batista 于 2021 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,项目编号为 PXD012453。关于数据质量评估指标、缺失值情况、重复性验证、样本量限制及潜在偏倚等信息,源站未提供。使用者在开展分析时应结合自身研究目的对数据适用性进行判断。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站描述中的引用信息:Michel Batista (2021). Integrated analysis of label-free quantitative proteomics and bioinformatics reveal insights into signaling pathways in male breast cancer [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD012453。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD012453

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Michel Batista (2021). Integrated analysis of label-free quantitative proteomics and bioinformatics reveal insights into signaling pathways in male breast cancer [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD012453

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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