Gamma Secretase 抑制剂的化学空间分析:化学信息学表征

该数据集源自 doi.org,聚焦 Gamma Secretase 抑制剂与调节剂的化学空间分析,整合了 PubChem 经 PUG-REST 获取的仅功能性测定生物活性数据,以及 ChEMBL 的 FDA 批准药物和 NCI 数据库的 FDA 批准乳腺癌药物

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Chemical Space Analysis of Gamma Secretase Inhibitors: A Cheminformatic Characterisation

基本信息

模态
文本
大小
0.013876163 GB
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

Gamma Secretase 抑制剂的化学空间分析:化学信息学表征

Chemical Space Analysis of Gamma Secretase Inhibitors: A Cheminformatic Characterisation

该数据集源自 doi.org,聚焦 Gamma Secretase 抑制剂与调节剂的化学空间分析,整合了 PubChem 经 PUG-REST 获取的仅功能性测定生物活性数据,以及 ChEMBL 的 FDA 批准药物和 NCI 数据库的 FDA 批准乳腺癌药物。基于 SMILES 用 RDKit 2023.09 计算 21 个描述符,经去重、剔除模糊矛盾及结构未注释记录、盐、混合物和不一致互变异构或质子化状态后形成合并数据集,可用于化学信息学与机器学习驱动的药物发现研究(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):通过 PUG-REST 接口从 PubChem 检索 gamma-secretase 抑制剂和调节剂的生物活性数据,用于化学空间分析。仅保留报告 gamma-secretase 抑制或调节的功能性测定,包括底物切割、Aβ 生成和酶抑制测定。FDA 批准药物来自 ChEMBL,而 FDA 批准乳腺癌药物(FDA BC drugs)来自美国国家癌症研究所(NCI)数据库。使用 RDKit 2023.09 从 SMILES 表示计算了 21 个描述符。在去除重复、模糊、矛盾及结构未注释的记录、盐、混合物以及不一致的互变异构或质子化状态后,创建了合并数据集。这些文件用于化学空间分析和化学信息学研究。

【主题与分类】

主题标签:Drug Discovery、Breast Cancer、Machine Learning、Cheminformatics、Computational Chemistry。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/yxfyv59jgb/2

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源站:https://doi.org/10.17632/yxfyv59jgb.2

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 13.9 MB。

数据说明

从PubChem使用PUG-REST接口检索得到的γ-分泌酶抑制剂和调节剂的生物活性数据,用于化学空间分析。仅保留了报告γ-分泌酶抑制或调节的功能性测定,包括底物裂解、Aβ生成和酶抑制测定。FDA批准药物从ChEMBL获取,而FDA批准的乳腺癌药物(FDA BC药物)则从美国国家癌症研究所(NCI)数据库获得。使用RDKit 2023.09从SMILES表示计算了21个描述符。在去除重复、模糊、矛盾及结构未注释的记录、盐、混合物以及不一致的互变异构或质子化状态后,创建了一个合并数据集。这些文件用于化学空间分析和化学信息学研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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