Cell Maps for Artificial Intelligence 2026年6月数据发布(Beta)

该数据集为 NIH Bridge2AI 计划中 CM4AI 项目的 2026 年 6 月 Beta 数据发布,聚焦 MDA-MB-468 乳腺癌细胞(±紫杉醇或伏立诺他)与 iPSC(±分化)的多模态数据

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基因组预测Medicine, Health and Life SciencesAIaffinity purificationAP-MSartificial intelligencebreast cancerBridge2AIcardiomyocyteCM4AICRISPR/Cas9induced pluripotent stem celliPSC
Cell Maps for Artificial Intelligence - June 2026 Data Release (Beta)

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19
版本
2.0

资源简介

Cell Maps for Artificial Intelligence 2026年6月数据发布(Beta)

Cell Maps for Artificial Intelligence - June 2026 Data Release (Beta)

该数据集为 NIH Bridge2AI 计划中 CM4AI 项目的 2026 年 6 月 Beta 数据发布,聚焦 MDA-MB-468 乳腺癌细胞(±紫杉醇或伏立诺他)与 iPSC(±分化)的多模态数据。内容涵盖 Perturb-seq、SEC-MS、AP-MS 及免疫荧光图像,涉及蛋白互作、空间定位与遗传扰动信息。数据可用于训练和评估人工智能模型,支持乳腺癌及 iPSC 相关功能基因组学研究(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):描述 本数据集为 Cell Maps for Artificial Intelligence(CM4AI;CM4AI.org)的 2026 年 6 月数据发布,该项目是 NIH Bridge2AI 计划中的功能基因组学重大挑战。CM4AI 正在生成多模态数据,包括 MDA-MB-468 乳腺癌细胞(±紫杉醇或伏立诺他)和 iPSC(±分化)中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、空间定位和遗传扰动数据。本 Beta 发布包括:MDA-MB-468 乳腺癌细胞 ± 处理及未分化(亲本)KOLF2.1J iPSC 的 Perturb-seq 数据;MDA-MB-468 乳腺癌细胞 ± 处理、未分化 KOLF2.1J iPSC 以及 iPSC 来源的神经祖细胞(NPC)、神经元和心肌细胞的 SEC-MS 数据;MDA-MB-468 乳腺癌细胞 + 处理的 AP-MS 数据;MDA-MB-468 乳腺癌细胞 ± 处理的 IF 图像;外部数据链接 访问外部数据资源 re

【主题与分类】

主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、AI、affinity purification、AP-MS、artificial intelligence、breast cancer、Bridge2AI、cardiomyocyte、CM4AI、CRISPR/Cas9。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://dataverse.lib.virginia.edu/citation?persistentId=doi:10.18130/V3/HIGT4C

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数据集获取

源站:https://doi.org/10.18130/v3/higt4c

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

<h3>描述</h3> <p>本数据集为人工智能细胞图谱(Cell Maps for Artificial Intelligence,CM4AI;CM4AI.org)2026年6月数据发布版,该图谱是NIH Bridge2AI计划中的功能基因组学重大挑战项目。CM4AI正在生成多模态数据,包括MDA-MB-468乳腺癌细胞(+/-紫杉醇或伏立诺他)和iPSCs(+/-分化)中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、空间定位和遗传扰动数据。</p>

本次Beta版发布包含:</p> <ul> <li>MDA-MB-468乳腺癌细胞(+/-处理)及未分化(亲本)KOLF2.1J iPSCs的Perturb-seq数据</li> <li>MDA-MB-468乳腺癌细胞(+/-处理)、未分化KOLF2.1J iPSCs以及iPSC来源的神经祖细胞(NPCs)、神经元和心肌细胞的SEC-MS数据</li> <li>MDA-MB-468乳腺癌细胞(+处理)的AP-MS数据</li> <li>MDA-MB-468乳腺癌细胞(+/-处理)的IF图像</li> </ul> <h3>外部数据链接</h3> <p>访问与本数据集相关的外部数据资源:</p> <ul> <li><strong>KOLF2.1J iPSCs(未分化)的Perturb-seq数据:</strong>禁运中</li> <li><strong>MDA-MB-468乳腺癌细胞(+/-处理)的Perturb-seq数据:</strong>禁运中</li> <li><strong>iPSCs的CRISPRi扰动图谱:</strong><a href=“https://figshare.com/s/ee85bb1880921326249b” target=“_blank”>Figshare</a></li> <li><strong>KOLF2.1J iPSCs(未分化、NPC、神经元和心肌细胞)的SEC-MS数据:</strong><a href=“https://massive.ucsd.edu/ProteoSAFe/dataset.jsp?task=de876e1d228c4f7ab02f84027894bed7” target=“_blank”>MassIVE Repository</a></li> <li><strong>MDA-MB-468 b

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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