人HER2阳性乳腺癌细胞系2D培养潜在标志物表征数据集
该数据集表征二维乳腺癌模型中基础生长条件下标志基因表达的变化以及添加肝素培养物中细胞增殖的变化。为验证此目的，两种代表人HER2阳性乳腺癌的人乳腺癌细胞系（SKBR3和MDA-MB-453）在基础生长培养基中培养至80%汇合
基本信息
资源简介
人HER2阳性乳腺癌细胞系2D培养潜在标志物表征数据集
该数据集聚焦人HER2阳性乳腺癌细胞系的二维培养表征，围绕潜在标志物在基础生长条件与添加肝素培养条件下的变化展开。研究对象为两种代表人HER2阳性乳腺癌的人乳腺癌细胞系SKBR3与MDA-MB-453，均在基础生长培养基中培养至80%汇合后进行后续分析。数据集一方面记录标志基因表达谱的变化，另一方面记录不同浓度肝素处理下细胞增殖的动态变化，从而为二维乳腺癌模型中标志物表征提供实验数据支撑。数据集由Hoang Son Pham撰写，机构为Mendeley，于2022年发布，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，来源站为doi.org，本站分类归入肿瘤／乳腺癌方向。
【数据集背景】
该数据集旨在表征二维乳腺癌模型中标志基因表达的变化，以及添加肝素培养物中细胞增殖的变化。为验证这一目的，研究者选用两种人乳腺癌细胞系SKBR3和MDA-MB-453，二者均代表HER2阳性乳腺癌。研究在基础生长条件下考察标志基因表达谱，并在添加肝素的培养条件下考察细胞增殖情况，形成对二维培养模型的双维度刻画。源站描述在此处未完整给出后续内容，相关背景信息以现有描述为限。
【数据内容】
数据内容主要包括两部分。第一部分是标志基因表达谱：细胞在基础生长培养基中培养至80%汇合后收获总RNA，RNA被转换为cDNA，随后通过Q-PCR检查基因表达。基因表达面板包括成纤维细胞生长因子、受体、细胞角蛋白以及WNT信号通路组分。第二部分是细胞增殖变化：两种乳腺癌细胞在24孔板中培养，并以不同浓度的肝素处理，从第1天到第7天收集细胞并进行计数，总活细胞通过细胞血细胞计数仪检查。源站描述在“For th”处中断，后续内容未提供。
【采集与来源】
数据采集依托两种HER2阳性乳腺癌细胞系SKBR3与MDA-MB-453的二维培养实验。基因表达方面，细胞在基础生长培养基中生长至80%汇合，收获总RNA并逆转录为cDNA，采用Q-PCR进行表达检测。增殖方面，细胞在24孔板中接受不同浓度肝素处理，并在第1天至第7天连续收集与计数，活细胞总数由细胞血细胞计数仪测定。数据集来源站为doi.org，作者为Hoang Son Pham，机构为Mendeley，发布时间为2022年。
【适用场景】
该数据集适用于二维乳腺癌模型中标志基因表达与细胞增殖变化的表征研究，尤其针对HER2阳性乳腺癌细胞系SKBR3和MDA-MB-453在基础生长条件及肝素添加条件下的表现。其基因表达面板覆盖成纤维细胞生长因子、受体、细胞角蛋白与WNT信号通路组分，可用于相关通路与标志物的表达层面观察；其增殖数据覆盖不同肝素浓度下第1天至第7天的活细胞计数，可用于细胞增殖动态的考察。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
使用时可根据研究目的分别调用基因表达数据与细胞增殖数据。基因表达部分对应基础生长条件下培养至80%汇合后经总RNA提取、cDNA转换与Q-PCR检测所得的标志基因表达谱；增殖部分对应24孔板中不同浓度肝素处理、第1天至第7天收集并用细胞血细胞计数仪计数的总活细胞数据。数据的具体文件组织、字段格式与读取方式源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于两种HER2阳性乳腺癌细胞系的二维培养模型，实验条件包括基础生长培养基培养至80%汇合以及不同浓度肝素处理下的增殖计数，检测手段为Q-PCR与细胞血细胞计数仪。其局限在于源站描述在“For th”处中断，后续内容未提供，因此无法获知描述中可能包含的更多细节；此外，数据仅涉及二维培养体系与上述两种细胞系，其他质量评估信息源站未提供。
【引用与许可】
该数据集作者为Hoang Son Pham，机构为Mendeley，发布时间为2022年，来源站为doi.org。许可方式为Creative Commons Attribution 4.0 International，使用时应遵循该许可的署名要求。具体引用格式与doi标识源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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数据集获取
源站：https://doi.org/10.17632/6d3465w95h
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 942.2 KB。
数据说明
该数据集描述了在基础生长条件下以及添加肝素培养体系中细胞增殖时，二维乳腺癌模型中标志性基因表达的变化。为验证这一目的，将代表HER2阳性乳腺癌的两种人乳腺癌细胞系（SKBR3和MDA-MB-453）在基础生长培养基中培养至80%汇合度。对于标志性基因表达谱，收集细胞总RNA，并将RNA转换为cDNA，通过Q-PCR检测基因表达。基因表达面板包括成纤维细胞生长因子、受体、细胞角蛋白和WNT信号通路组分。对于细胞增殖变化，将两种乳腺癌细胞在经不同浓度肝素处理的24孔板中培养；随后从第1天到第7天收集细胞并进行计数。总活细胞通过细胞血细胞计数仪检测。对于该数据集，细胞以生物学三重重复培养，实验以技术四重重复进行。细胞生物学和肿瘤学领域的研究人员将从这些数据中受益。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
