弥漫性胶质瘤组织代谢物及其受IDH1突变、组织学和治疗调控

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS3873

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在异柠檬酸脱氢酶1突变（IDH1突变）肿瘤实体中发现肿瘤代谢物2-羟基戊二酸，证实了代谢在癌症中的作用。然而，包含受IDH1突变调控的组织代谢物的大型数据库仍处于发展阶段。在此，我们呈现了一份前所未有的宝贵资源，涵盖弥漫性胶质瘤中的组织代谢物及其受IDH1突变、组织学和肿瘤治疗调控的情况，样本来自73例弥漫性胶质瘤患者的101份组织样本（24例星形细胞瘤、17例少突胶质细胞瘤、32例胶质母细胞瘤），采用基于NMR的代谢组学进行研究，并辅以RNA-Seq支持。我们发现了受IDH1（IDH1突变状态队列）和肿瘤实体调控的比较特异性代谢物和通路。纵向研究队列提供了未经治疗和相应治疗后胶质瘤样本在首次进展时的代谢谱。最有趣的是，单变量和多变量Cox回归及Kaplan-Meier分析显示，组织代谢物与无进展生存期和总生存期相关。

因此，本研究为未来的前瞻性临床研究引入了潜在的新型候选预后和替代代谢物生物标志物，旨在进一步完善弥漫性胶质瘤的患者分层。此外，我们的数据将有助于为实验研究生成迄今未预料到的假设，以推进我们对胶质瘤生物学的分子理解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。