术中质谱快速检测胶质瘤IDH突变

该数据集来自 Purdue University Research Repository,聚焦于利用术中质谱技术快速检测胶质瘤中的 IDH 突变状态

Purdue University Research RepositoryPurdue University Research Repository
datacite
浏览 14
基因组分类Mass SpectrometryBrainSurgeryAnalytical ChemistryFOS: Chemical sciences
Rapid Detection of IDH Mutations in Gliomas by Intraoperative Mass Spectrometry

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-09
版本
1.0

资源简介

术中质谱快速检测胶质瘤IDH突变

Rapid Detection of IDH Mutations in Gliomas by Intraoperative Mass Spectrometry

该数据集来自 Purdue University Research Repository,聚焦于利用术中质谱技术快速检测胶质瘤中的 IDH 突变状态。胶质瘤是中枢神经系统最常见的肿瘤,IDH 突变状态对诊断和预后具有重要意义,IDH 突变型患者生存率更高。由于胶质瘤呈弥漫性生长,最大程度切除肿瘤困难,而常用的免疫组化和基因检测无法满足术中快速诊断需求。该数据可用于开发术中质谱诊断方法,辅助区分 IDH 突变型与野生型胶质瘤(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质瘤是中枢神经系统最常见的肿瘤。根据世界卫生组织(WHO)中枢神经系统肿瘤分类,成人胶质瘤分为 IDH 突变型(IDH-mut)和 IDH 野生型(IDH-wt)。IDH 突变状态在诊断和预后中起重要作用,因为 IDH 突变型胶质瘤患者表现出更高的生存率。通过开颅手术进行肿瘤切除是胶质瘤患者最重要的预后调节因素。然而,由于胶质瘤的弥漫性,实现最大程度肿瘤切除很困难,这需要灵敏且快速的术中诊断工具。常用的分子诊断方法,即免疫组织化学(IHC)和基因检测,无法满足术中评估的要求。IDH-mut 酶将 α-酮戊二酸转化为 2-羟

【主题与分类】

主题标签:Mass Spectrometry、Brain、Surgery、Analytical Chemistry。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://purr.purdue.edu/publications/4515/1

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.4231/6x3a-h790

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质瘤是中枢神经系统最常见的肿瘤。根据世界卫生组织(WHO)中枢神经系统肿瘤分类,成人胶质瘤被分为IDH突变型(IDH-mut)和IDH野生型(IDH-wt)。IDH突变状态在诊断和预后中起着重要作用,因为IDH突变型胶质瘤患者的生存率更高。通过开颅手术进行肿瘤切除是胶质瘤患者最重要的预后调节因素。然而,由于胶质瘤的弥漫性特征,实现最大程度的肿瘤切除十分困难,这要求术中诊断工具既灵敏又快速。常用的分子诊断方法,如免疫组织化学(IHC)和基因检测,无法满足术中评估的需求。IDH突变型酶将α-酮戊二酸转化为2-羟基戊二酸(2HG),后者是IDH突变型胶质瘤中特有的致癌代谢物。解吸电喷雾电离质谱(DESI-MS)和直接毛细管喷雾(DCS)质谱是快速且灵敏的工具,能够以最少的样本制备检测脑组织中的IDH突变。

该数据集包含串联质谱结果,这些结果分别由美国佛罗里达州杰克逊维尔梅奥诊所的DESI-MS和中国上海华山医院的DCS-MS在术中获取。此处提供的结果代表了所收集的全部数据;其中包括梅奥诊所53号受试者八份组织活检的DESI-MS数据。</p>

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案