伴或不伴胼胝体受累的胶质瘤基因改变、临床信息与生存数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Adbecb380d6822ee95dea4a45ce1fcaf296cf473ac4a14b57c562a044fc665bac

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的原始数据集包含胶质瘤患者的基因改变、临床信息和生存数据。基因改变数据通过患者胶质瘤样本的二代DNA测序获得。临床信息来自电子病历和随访。生存数据通过患者随访获得。为了探究基因改变及其与胼胝体（CC）受累的胶质母细胞瘤（ccGBM）生存的相关性，对该数据集进行了详细分析。最终共纳入30例ccGBM和88例非ccGBM。ccGBM中PDGFRA改变的发生率高于非ccGBM（33.3% vs 9.1%，P=0.004）。PDGFRA扩增（PDGFRAamp，33.3% vs 9.1%，P=0.004）和错义突变（PDGFRAmut，20.0% vs 3.4%，P=0.011）在ccGBM中的发生率均高于非ccGBM。PDGFRA改变与ccGBM的发生显著相关（OR=4.91 [95%CI：1.55-15.52]，P=0.007）。PDGFRAamp的ccGBM患者的中位PFS（8.6 vs 13.5个月，P=0.025）和OS（12.4 vs 17.9个月，P=0.022）均短于PDGFRAnon-amp的非ccGBM患者。

PDGFRAamp合并PDGFRAmut的ccGBM（PDGFRAamp-mut）其中位PFS（7.6个月 vs 8.9个月，P=0.022）和OS（9.6个月 vs 17.8个月，P=0.006）均短于PDGFRA野生型且非扩增的非ccGBM（PDGFRA-w, non-amp）。与PDGFRA-w, non-amp的ccGBM相比，PDGFRAamp和PDGFRAamp-mut的ccGBM其中位PFS和OS均更短（P<0.05）。PDGFRAamp对ccGBM的PFS和OS的风险比（HR）分别为3.08（95%CI：1.02-9.35，P=0.047）和5.07（95%CI：1.52-16.89，P=0.008），PDGFRAamp-mut对PFS和OS的HR分别为13.16（95%CI：3.19-54.40，P<0.001）和16.36（95%CI：2.66-100.70，P=0.003）。PDGFRA改变与ccGBM的发生及不良预后显著相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。