TCGA-GBM 系列的 DICOM 转换幻灯片显微图像
该数据集对应于美国国家癌症研究所成像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录
基本信息
资源简介
TCGA-GBM 系列的 DICOM 转换幻灯片显微图像
该数据集英文名为 DICOM converted Slide Microscopy images for the TCGA-GBM collection，属于肿瘤领域中脑肿瘤相关数据。它对应美国国家癌症研究所成像数据共享平台（IDC）所提供的一组图像和/或图像衍生数据，已由 IDC 团队转换为 DICOM 表示形式并收录。数据集来源站为 doi.org，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika 与 Fedorov, Andrey。该数据集可用于探索和可视化对应的图像，并通过 IDC Portal 进行查看，同时提供清单文件以支持按说明下载整个集合。
【数据集背景】
该数据集与 TCGA-GBM 集合相关，属于肿瘤分类下的脑肿瘤方向。根据源站描述，该数据集对应于美国国家癌症研究所成像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集被转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队完成收录。癌症成像计划（CIP）正与参与 TCGA 的机构的主要研究者直接合作，以获取并加载与 TCGA 数据门户中存储的基因组、临床和病理数据相关的图像。当前这一大型胶质母细胞瘤患者 MR 多序列图像集合，可以通过每个唯一病例标识符与来自 The Cancer Genome Atlas Data 的同一病例的广泛基因和表达数据进行匹配。
【数据内容】
该数据集为 DICOM converted Slide Microscopy images for the TCGA-GBM collection，涉及图像和/或图像衍生数据。源站描述指出，该数据集对应于 IDC 提供的一组图像和/或图像衍生数据，并已转换为 DICOM 表示形式。关于具体的图像数量、切片数量、文件大小、分辨率、染色方法、扫描设备参数等详细内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 doi.org，机构为 Zenodo。源站描述说明，该数据集对应于美国国家癌症研究所成像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据，并由 IDC 团队转换为 DICOM 表示形式并收录。癌症成像计划（CIP）正与参与 TCGA 的机构的主要研究者直接合作，以获取并加载与 TCGA 数据门户中存储的基因组、临床和病理数据相关的图像。关于具体的采集地点、采集时间、扫描协议、设备型号等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于探索和可视化对应的图像，用户可以通过 IDC Portal 进行查看。源站描述提到，这一大型胶质母细胞瘤患者 MR 多序列图像集合可以通过每个唯一病例标识符与来自 The Cancer Genome Atlas Data 的同一病例的广泛基因和表达数据进行匹配。因此，该数据集适用于与 TCGA-GBM 相关的图像查看、图像衍生数据分析以及基于唯一病例标识符与基因组、临床和病理数据进行关联研究的场景。关于其他具体适用场景，源站未提供。
【使用方法】
根据源站描述，用户可以使用 IDC Portal 探索和可视化对应的图像。此外，可以使用该 Zenodo 记录中包含的清单文件，按照下载说明下载整个集合。关于更详细的使用步骤、软件环境、处理流程等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录。源站描述提到，该数据集对应于 IDC 提供的一组图像和/或图像衍生数据。关于数据质量、完整性、潜在偏差、使用限制等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的许可为 Creative Commons Attribution 3.0 Unported。作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika 与 Fedorov, Andrey。机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，来源站为 doi.org。关于具体的引用格式、引用要求等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22837367
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 640.3 KB。
数据说明
本数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）提供的一系列图像和/或源自图像的数据。该数据集已被IDC团队转换为DICOM格式并录入。您可以使用IDC门户网站探索并可视化相应的图像。您可利用本Zenodo记录中包含的清单，按照下方下载指南下载该集合。癌症影像计划（CIP）正与参与TCGA的研究机构的主要研究者直接合作，获取并加载与TCGA数据门户中存储的基因组、临床和病理数据相关的图像。目前，这个大型的胶质母细胞瘤患者MR多序列图像集合，可以通过每个独特病例标识符与来自癌症基因组图谱数据门户的同一病例的广泛基因和表达数据进行匹配，以研究临床表型与组织基因组之间的联系。访问TCGA-GBM页面，了解有关图像的更多信息，并获取该集合的任何支持性元数据。
包含的文件 清单文件的名称指示了集合数据某个版本首次引入时所对应的 IDC 数据发布版本。例如，tcga_gbm-idc_v22-aws.s5cmd 对应 IDC 数据发布 v22 中引入的 tcga_gbm 集合内容。 tcga_gbm-idc_v25-aws.s5cmd：AWS 下载清单 tcga_gbm-idc_v25-gcs.s5cmd：GCS 下载清单 tcga_gbm-idc_v25-dcf.dcf：DCF 下载清单 以 -aws.s5cmd 结尾的清单文件引用 Amazon Web Services (AWS) 存储桶中的文件；以 -gcs.s5cmd 结尾的清单文件引用 Google Cloud Storage 中的文件。实际文件完全相同，并在 AWS 与 GCP 之间镜像。 下载说明 每个清单文件都在其头部包含有关如何下载所包含文件的说明。要使用 .s5cmd 清单下载文件： 安装 idc-index：pip install --upgrade idc-index 下载此数据集中包含的某个清单所引用的文件：idc download manife
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
