乳腺、结肠、胶质母细胞瘤、肺、黑色素瘤、卵巢、胰腺、前列腺肿瘤及细胞系

主题标签:肿瘤、脑肿瘤、乳腺癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肺癌、黑色素瘤、细胞系。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。

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基因组分类肿瘤脑肿瘤乳腺癌结肠癌胶质母细胞瘤肺癌黑色素瘤细胞系
Breast, colon, glioblastoma, lung, melanoma, ovarian, pancreas, prostate tumors and cell lines.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

乳腺、结肠、胶质母细胞瘤、肺、黑色素瘤、卵巢、胰腺、前列腺肿瘤及细胞系

该数据集英文名为“Breast, colon, glioblastoma, lung, melanoma, ovarian, pancreas, prostate tumors and cell lines.”,是一项面向肿瘤研究领域的公开数据集,主题涵盖肿瘤与脑肿瘤,具体涉及乳腺癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌等肿瘤类型及其细胞系。数据集来源于ebi.ac.uk,源站记录显示其由Yi Su、Scott Powers与Ken Nguyen于2011年发布,可通过ArrayExpress实验编号E-GEOD-31586访问。从主题标签看,该数据集围绕多种实体瘤与肿瘤细胞系展开,适合作为肿瘤相关研究的公开数据资源使用。以下依据可获得的信息,从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集于2011年发布,发布者包括Yi Su、Scott Powers和Ken Nguyen,收录于EBI ArrayExpress平台,实验编号为E-GEOD-31586。数据集名称直接列出了所覆盖的肿瘤类型与细胞系,包括乳腺癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌和前列腺癌。从主题分类看,该数据集归属于肿瘤领域,并涉及脑肿瘤方向,其中胶质母细胞瘤属于脑肿瘤范畴。数据集以多种肿瘤及其细胞系为对象,体现了跨瘤种的组织方式,便于在统一资源下检索和比较不同肿瘤类型的数据。

【数据内容】

数据集的主题标签包括肿瘤、脑肿瘤、乳腺癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肺癌、黑色素瘤、细胞系。由此可知,数据内容涉及上述多种肿瘤类型以及相应的细胞系材料。数据集名称中“tumors and cell lines”的表述表明,其对象既包括肿瘤样本,也包括细胞系。关于具体的样本数量、检测平台、数据类型(如表达谱、基因组变异等)、文件格式与数据规模,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于ebi.ac.uk,具体收录于ArrayExpress数据库,实验编号为E-GEOD-31586。源站描述中给出了数据集的正式引用信息,包括作者Yi Su、Scott Powers、Ken Nguyen,发布年份2011年,以及数据集标题和访问链接。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验处理流程与测序或芯片平台细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题覆盖范围,该数据集可用于涉及乳腺癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌等肿瘤类型的研究场景,也可用于涉及肿瘤细胞系的比较性分析。由于主题标签同时包含肿瘤与脑肿瘤,该数据集亦适合脑肿瘤相关研究方向参考使用。关于该数据集在具体分析任务中的验证用途或基准性能,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站给出的ArrayExpress实验编号E-GEOD-31586进行访问与获取。关于数据下载格式、预处理步骤、分析工具要求与使用教程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源站为ebi.ac.uk,具备正式的发布记录与引用信息。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本量大小与覆盖度等具体质量信息,源站未提供。使用时应以源站记录为准,并注意数据集名称所覆盖的肿瘤类型范围。

【引用与许可】

引用信息为:Yi Su; Scott Powers; Ken Nguyen (2011). Breast, colon, glioblastoma, lung, melanoma, ovarian, pancreas, prostate tumors and cell lines. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-31586/。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-31586

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Yi Su; Scott Powers; Ken Nguyen (2011). Breast, colon, glioblastoma, lung, melanoma, ovarian, pancreas, prostate tumors and cell lines. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-31586/

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