神经节胶质瘤深度转录组学附加文件6

该数据集为神经节胶质瘤深度转录组学研究论文的附加文件6,包含Supplementary Table 5,提供基于SnRNA-seq的CellChat聚类间相互作用p值(source x target),按显著配体-受体组合组织

google_dataset
2024-08-13 更新
浏览 2
基因组Single cell RNA-sequencingCITE-seqSpatial transcriptomicsGangliogliomaGlioneuronal tumorsBrain tumorsGenetic signatures
Additional file 6 of Ganglioglioma deep transcriptomics reveals primitive neuroectoderm neural precursor-like population

基本信息

模态
基因组
大小
0.006112107 GB
许可
CC BY + CC0
创建/更新时间
2024-08-13
版本
v1

资源简介

神经节胶质瘤深度转录组学附加文件6

Additional file 6 of Ganglioglioma deep transcriptomics reveals primitive neuroectoderm neural precursor-like population

该数据集为神经节胶质瘤深度转录组学研究论文的附加文件6,包含Supplementary Table 5,提供基于SnRNA-seq的CellChat聚类间相互作用p值(source x target),按显著配体-受体组合组织。数据以单个Excel文件形式发布,主题涵盖单细胞RNA测序、CITE-seq、空间转录组学及脑肿瘤遗传特征,可用于分析神经节胶质瘤中细胞间通讯模式及配体-受体互作关系(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:Pediatric Brain Tumor Foundation St. Baldrick's Foundation Emily Beazley’s Kures for Kids Fund ChadTough Defeat DIPG funds from the Botha family developmental funds of the Duke Cancer Institute National Cancer Institute National Cancer Center for Advancing Translational Sciences of the National Institutes of Health Doris Duke Charitable Foundation。源站首次发布:2024-08-13。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):附加文件6:补充表5。SnRNA-seq CellChat聚类间相互作用p值(source x target),按显著配体-受体组合列出。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 6.11 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.26577686.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Cell Biology、Genetics、Neuroscience、Developmental Biology、Cancer。主题标签:Single cell RNA-sequencing、CITE-seq、Spatial transcriptomics、Ganglioglioma、Glioneuronal tumors、Brain tumors、Genetic signatures。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Neuroscience、Developmental Biology、Cancer。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_6_of_Ganglioglioma_deep_transcriptomics_reveals_primitive_neuroectoderm_neural_precursor-like_population/26577686

使用许可:CC BY + CC0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Regal, Joshua A.; Guerra García, María E.; Jain, Vaibhav; Chandramohan, Vidyalakshmi; Ashley, David M.; Gregory, Simon G.; et al. (2023). Additional file 6 of Ganglioglioma deep transcriptomics reveals primitive neuroectoderm neural precursor-like population. figshare. Dataset

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "40478_2023_1548_MOESM6_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/48400295"

文件清单

  • 40478_2023_1548_MOESM6_ESM.xlsx(6.11 MB)

文件总体积 6.11 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Additional file 6: Supplementary Table 5. SnRNA-seq CellChat cluster-cluster interaction p-values (source x target) by significant ligand-receptor combination.

许可

CC BY + CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.26577686.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_6_of_Ganglioglioma_deep_transcriptomics_reveals_primitive_neuroectoderm_neural_precursor-like_population/26577686)。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案