人类多能干细胞模拟肌生成揭示Duchenne肌营养不良症骨骼肌定向前的表型数据
主题标签：Duchenne肌营养不良症、人类多能干细胞、肌生成、骨骼肌、蛋白质组学、PRIDE。本站分类：肌肉骨骼系统疾病
基本信息
资源简介
人类多能干细胞模拟肌生成揭示Duchenne肌营养不良症骨骼肌定向前的表型数据
该数据集围绕人类多能干细胞建模的肌生成过程展开，用于揭示杜氏肌营养不良症（Duchenne muscular dystrophy）在骨骼肌定向分化之前即已出现的表型。数据集全称为“Data from: Myogenesis modelled by human pluripotent stem cells uncovers Duchenne muscular dystrophy phenotypes prior to skeletal muscle commitment”，来源于 ebi.ac.uk，在站内归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别。其主题标签涵盖杜氏肌营养不良症、人类多能干细胞、肌生成、骨骼肌、蛋白质组学与 PRIDE。整体而言，该数据集为研究杜氏肌营养不良症早期病理机制、特别是骨骼肌分化承诺之前的分子变化提供了蛋白质组学层面的数据资源，适合从事神经肌肉疾病、干细胞分化与蛋白质组学研究的科研人员参考使用。
【数据集背景】
杜氏肌营养不良症是一种严重的肌肉骨骼系统疾病，其病理机制研究长期关注骨骼肌成熟后的功能缺陷。该数据集所对应的研究以人类多能干细胞为模型系统，对肌生成过程进行建模，旨在捕捉杜氏肌营养不良症在骨骼肌承诺（skeletal muscle commitment）之前就已出现的表型。这一背景使数据集具有明确的疾病机制研究导向，聚焦于分化早期阶段的分子事件，而非终末成熟肌纤维的功能表现。
【数据内容】
数据集的主题标签包括杜氏肌营养不良症、人类多能干细胞、肌生成、骨骼肌、蛋白质组学与 PRIDE。由此可知，数据内容属于蛋白质组学范畴，围绕人类多能干细胞向骨骼肌方向分化过程中的蛋白质层面信息展开。数据在站内分类中归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数目、定量指标或文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，对应 PRIDE 归档项目，项目标识为 PXD015355。源站描述中列出的作者为 Michael Sweredoski，数据集以“Myogenesis modelled by human pluripotent stem cells uncovers Duchenne muscular dystrophy phenotypes prior to skeletal muscle commitment”为题收录。除上述来源信息外，关于样本采集流程、细胞系来源、质谱平台与实验设计等具体内容，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题构成，该数据集适用于杜氏肌营养不良症早期病理机制研究、人类多能干细胞肌生成模型的分化过程分析，以及骨骼肌承诺前后蛋白质组变化的比较研究。对于关注神经肌肉疾病体外建模、干细胞定向分化以及蛋白质组学数据再利用的研究者，该数据集可作为参考资源。需要说明的是，具体适用场景的边界与验证条件源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 PRIDE 归档项目（PXD015355）发布，使用者可依据该归档标识在对应平台上检索与获取数据。关于数据下载格式、检索方式、分析流程与软件参数等操作层面的说明，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为蛋白质组学归档数据，其质量评估依赖于原始实验设计与数据处理流程，相关细节源站未提供。使用时应注意到，数据集聚焦于骨骼肌承诺之前的早期表型，其结论范围不宜直接外推至成熟骨骼肌阶段。关于数据完整性、重复性及潜在偏差等信息，源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时，可参考源站描述中给出的条目：Michael Sweredoski, Myogenesis modelled by human pluripotent stem cells uncovers Duchenne muscular dystrophy phenotypes prior to skeletal muscle commitment [Dataset], https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015355。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015355
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Michael Sweredoski, Myogenesis modelled by human pluripotent stem cells uncovers Duchenne muscular dystrophy phenotypes prior to skeletal muscle commitment [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015355
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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