对比Becker与Duchenne型肌营养不良血清生物标志物候选物的数据独立采集LC-MS/MS附加文件2
主题标签:肌肉骨骼系统疾病、Duchenne肌营养不良、Becker肌营养不良、血清生物标志物、蛋白质组学、LC-MS/MS

基本信息
资源简介
对比Becker与Duchenne型肌营养不良血清生物标志物候选物的数据独立采集LC-MS/MS附加文件2
该数据集英文名为 Additional file 2 of Contrasting Becker and Duchenne muscular dystrophy serum biomarker candidates by using data independent acquisition LC-MS/MS,在站内归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,来源站为 ebi.ac.uk。从名称与主题标签看,该数据集围绕肌肉骨骼系统疾病中的 Duchenne 肌营养不良与 Becker 肌营养不良,采用数据非依赖采集(DIA)液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术对比两类疾病相关的血清生物标志物候选物,属于蛋白质组学范畴。源站描述同时指向一项针对 Duchenne 肌营养不良猪模型的骨骼肌样本蛋白质组分析,该模型接受了体细胞基因编辑处理。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍。
【数据集背景】
Duchenne 肌营养不良与 Becker 肌营养不良同属肌营养不良症谱系,二者在临床进程与分子特征上存在差异,寻找能够区分二者的血清生物标志物候选物是蛋白质组学研究关注的方向之一。该数据集正是以“对比 Becker 与 Duchenne 肌营养不良血清生物标志物候选物”为主题,采用数据非依赖采集 LC-MS/MS 开展分析。源站描述还提到一项针对 Duchenne 肌营养不良猪模型的骨骼肌样本蛋白质组分析,该模型经体细胞基因编辑处理,说明相关研究背景涉及动物模型与基因编辑干预条件下的蛋白质组表征。
【数据内容】
该数据集为“Additional file 2”,即某项研究或项目成果的补充文件之二,其核心内容与采用数据非依赖采集 LC-MS/MS 对比 Becker 和 Duchenne 肌营养不良血清生物标志物候选物有关。主题标签涵盖肌肉骨骼系统疾病、Duchenne 肌营养不良、Becker 肌营养不良、血清生物标志物、蛋白质组学与 LC-MS/MS,表明数据内容属于蛋白质组学质谱分析范畴,关注血清样本中的生物标志物候选物。关于补充文件内具体包含的样本数量、蛋白或肽段鉴定数目、定量指标及统计结果等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk。源站描述指向 Thomas Fröhlich(2026)的蛋白质组分析数据集,题为“Proteome analysis of skeletal muscle samples from a porcine model of Duchenne muscular dystrophy treated by somatic gene editing”,其项目地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD014893。该描述表明相关数据来自对接受体细胞基因编辑治疗的 Duchenne 肌营养不良猪模型骨骼肌样本的蛋白质组分析。关于血清样本的具体采集流程、质谱仪器型号、色谱条件与数据处理软件等实验细节,源站未提供。
【适用场景】
基于主题标签与数据集名称,该数据集适用于肌肉骨骼系统疾病特别是肌营养不良症相关的蛋白质组学研究场景,可用于关注 Duchenne 与 Becker 肌营养不良血清生物标志物候选物对比的分析工作,也可为采用数据非依赖采集 LC-MS/MS 的蛋白质组学方法学参考提供素材。由于源站描述涉及 Duchenne 肌营养不良猪模型与体细胞基因编辑,该数据集亦可能与动物模型蛋白质组表征及基因编辑干预效果相关的研究场景有关。关于更具体的适用场景说明,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以“Additional file 2”形式提供,属于补充文件性质。关于文件的具体格式、字段结构、下载方式以及配套分析流程,源站未提供。使用者如需了解如何读取与复用这些数据,应参考源站项目页面 PXD014893 的相关说明。
【质量与限制】
该数据集为补充文件,其内容范围受原始研究设计约束。关于数据集的样本规模、数据完整性、质控指标、缺失值情况以及技术重复等信息,源站未提供。由于数据集名称指向血清生物标志物候选物对比,而源站描述指向猪模型骨骼肌样本蛋白质组分析,二者在样本类型与物种层面的对应关系需以源站原始记录为准,现有信息不足以对此作出进一步判断。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参考源站描述中给出的条目:Thomas Fröhlich (2026). Proteome analysis of skeletal muscle samples from a porcine model of Duchenne muscular dystrophy treated by somatic gene editing [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD014893。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD014893
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Thomas Fröhlich (2026). Proteome analysis of skeletal muscle samples from a porcine model of Duchenne muscular dystrophy treated by somatic gene editing [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD014893
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




