慢性伤口感染中铜绿假单胞菌毒力的演化

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aa5ea6d7e4ff9bae593b6adc3fd5734cb4e21e00a9342a6cc8faea52c41ba1407

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

机会性病原体与多种人类慢性感染相关，但这些生物在慢性感染过程中毒力的演化仍知之甚少。在此，我们利用两部分连续传代和脓毒症实验，在小鼠慢性伤口模型中测试了人类机会性病原体铜绿假单胞菌毒力的演化，发现毒力在每条演化谱系中朝不同方向演化。我们还评估了铜绿假单胞菌在演化42天后对慢性伤口的适应性，发现与我们演化群体中形态多样性相比，先前描述的囊性纤维化（CF）感染中的形态多样性更为丰富。利用全基因组测序，我们发现先前与铜绿假单胞菌致病性相关的基因（lasR、pilR、fleQ、rpoN和pvcA）在伤口演化过程中包含突变，且在所有演化谱系中平行发生选择。我们的发现强调：（i）铜绿假单胞菌……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。