PXD013115:不同毒力鸽毛滴虫克隆的膜蛋白组成比较

本项目比较毒力不同的两株Trichomonas gallinae克隆的细胞膜与细胞器膜蛋白质组成。毒力先在细胞培养中检测,从七株克隆中选出初始细胞病变效应(CPE)评分最高与最低的两株

pride
2019-10-10 更新
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蛋白质分类Label free proteomicsVirulenceTrichomonas gallinaeMembrane proteinsCloneGenotype
PXD013115: Comparative membrane protein composition of Trichomonas gallinae clones with different virulence

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-10-10

资源简介

PXD013115:不同毒力鸽毛滴虫克隆的膜蛋白组成比较

本项目比较毒力不同的两株Trichomonas gallinae克隆的细胞膜与细胞器膜蛋白质组成。毒力先在细胞培养中检测,从七株克隆中选出初始细胞病变效应(CPE)评分最高与最低的两株。实验采用非标记(label free)蛋白质组学方法(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目比较了两株毒力不同的鸡毛滴虫(Trichomonas gallinae)克隆其细胞膜和细胞器膜中存在的蛋白质组成。毒力首先在细胞培养中进行了检测。根据毒力差异,从7个克隆中选出了2个:具有最高初始细胞病变效应(CPE)评分的克隆和具有最低初始CPE评分的克隆。实验采用无标记方法进行。

【主题与分类】

主题标签:Label free proteomics、Virulence、Trichomonas gallinae、Membrane proteins、Clone、Genotype。本站分类:感染/寄生虫病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD013115

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

本项目比较了两株毒力不同的鸡毛滴虫(Trichomonas gallinae)克隆其细胞膜和细胞器膜中存在的蛋白质组成。毒力首先在细胞培养中进行了检测。根据毒力差异,从7个克隆中选出了2个:具有最高初始细胞病变效应(CPE)评分的克隆和具有最低初始CPE评分的克隆。实验采用无标记方法进行。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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