脑膜炎奈瑟菌CRISPR/Cas系统影响细菌黏附人鼻咽上皮细胞
该数据集来自NCBI GEO,包含脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis)CRISPR/Cas系统相关研究的高通量转录组测序数据,共1个文件

基本信息
资源简介
脑膜炎奈瑟菌CRISPR/Cas系统影响细菌黏附人鼻咽上皮细胞
The CRISPR/Cas system in Neisseria meningitidis affects bacterial adhesion to human nasopharyngeal epithelial cells
该数据集来自NCBI GEO,包含脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis)CRISPR/Cas系统相关研究的高通量转录组测序数据,共1个文件。研究比较了缺失Cas9蛋白的敲除株与对照株,发现Cas9缺失会削弱细菌对人鼻咽上皮细胞的黏附能力,而转录组数据提示Cas9并不影响经典表面黏附素的表达,可能以间接方式发挥作用。数据可用于分析Cas9对基因表达的调控、探索II-C型CRISPR/Cas系统在细菌致病性中的新功能,以及研究脑膜炎奈瑟菌黏附机制与侵袭性感染的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 20 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):脑膜炎奈瑟菌是人鼻咽部的共生β-变形菌,是全球脓毒症和流行性脑膜炎的主要病因。其“偶然”致病性的分子基础仍未完全阐明。在此,我们表明,缺乏Cas9蛋白的敲除株对人鼻咽上皮细胞的黏附能力受损,而黏附是侵袭性脑膜炎球菌疾病发病机制的核心步骤。转录组测序数据提示,脑膜炎球菌Cas9并不影响经典表面黏附素的表达,而是以间接方式对细胞黏附发挥作用。因此,我们推测脑膜炎球菌II-C型CRISPR/Cas系统在其防御外源DNA的已知作用之外还发挥新功能。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24628、604162。本站分类:感染性疾病/脓毒症。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE110891
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 31 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
脑膜炎奈瑟菌是寄居于人类鼻咽部的β-变形菌门共生菌,也是全球范围内败血症和流行性脑膜炎的主要致病原因。其“偶然性”致病性的分子基础至今尚未完全阐明。本研究表明,缺失Cas9蛋白的敲除菌株对人鼻咽细胞的黏附能力受损,而黏附是侵袭性脑膜炎球菌疾病发病机制中的核心步骤。转录组测序数据提示,脑膜炎球菌Cas9并不影响经典表面黏附素的表达,而是以间接方式对细胞黏附发挥作用。因此,我们推测脑膜炎球菌II-C型CRISPR/Cas系统在其已确立的防御外源DNA功能之外,还发挥着新的功能。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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