自终止中继波实现人中性粒细胞群集稳态控制

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A8a432cc64291fdcd2340b098948e5e9aeb4edfad2dc62c602c2ba6bd18f9f183

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

中性粒细胞集体迁移至损伤和感染部位。这些集群如何协调以确保适当的募集水平尚不清楚。利用离体感染模型，我们发现人中性粒细胞的集群行为由多个搏动性趋化吸引波组织。这些波通过主动接力传播，其中受刺激的中性粒细胞触发其邻居释放额外的集群信号。与经典的主动接力不同，我们发现这些波是自我终止的，限制了细胞募集的空間范围。我们确定了一个基于NADPH氧化酶的负反馈环路，该环路是这种自我终止行为所必需的。我们观察到在广泛的起始条件下中性粒细胞募集水平几乎恒定，揭示了集群过程中令人惊讶的稳健性。这种稳态控制是通过在较低细胞密度下更大且更多的集群波来实现的。我们将缺陷性波终止与情境中断裂的募集稳态联系起来……中性粒细胞分离方案：首先用RPMI（无酚红，25mM HEPES，L-谷氨酸）和0.4%人血清白蛋白（HSA）（Sigma货号：A5843）制备成像培养基。

将HSA直接加入RPMI中，然后以500×g离心5分钟直至完全溶解。随后用0.22 μm Steriflip过滤器（Millipore Sigma：SE1M179M6）过滤混合液，以备后续使用。成像培养基始终在成像当天新鲜配制。患者血液标本依据加利福尼亚大学旧金山分校机构审查委员会批准的研究方案（研究编号#21-35147），在知情同意下获取。健康成年志愿者的外周血新鲜样本（2管，每管7 mL）通过BD 23号蝶形针采集套件（SKU：23-021-022）采集至10 mL BD Vacutainer EDTA管（SKU：366643）中。志愿者被告知在24小时内不要服用布洛芬、对乙酰氨基酚或饮用超过一杯酒精饮料，不要服用1类或2类抗组胺

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。