负相互作用与毒力差异驱动多物种细菌感染动态

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A84d44cf9f3f492e6edde2d729e9737e097ab35b23ae62d5f7bf780411ecea646

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细菌感染常为多种微生物混合感染，导致复杂的病原体-病原体及病原体-宿主相互作用。研究病原体相互作用的分子基础及其机制如何影响宿主发病率正日益受到关注。然而，关于病原体之间的生态动力学及其如何影响毒力和宿主存活，人们所知甚少。在此，我们通过将昆虫模型宿主大蜡螟（Galleria mellonella）幼虫与一种、两种、三种或四种细菌物种共感染来探讨这些未解问题，所有这些细菌均为机会性人类病原体。我们发现，无论注射的物种数量和病原体组合如何，宿主死亡率始终由毒力最强的物种决定。在某些组合中，毒力较强的病原体仅通过生长优势压倒了毒力较弱的病原体。在其他组合中，我们发现了病原体之间在宿主体内发生负相互作用的证据，其中毒力较强的病原体通常在竞争中获胜。综上所述……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。