基因数据集分析鉴定溃疡性结肠炎关键基因与功能共表达模块

源站描述围绕 DSS 诱导的 IBD 小鼠模型,比较感染单性日本血吸虫尾蚴与地塞米松阳性对照的保护效果,评估临床体征、组织病理学病变和肠道通透性,并检测 Th1/Th2 平衡与 Treg 细胞群体,同时涉及肠道菌群变化

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2023-06-01 更新
浏览 11
医学影像分类inflammatory bowel diseasemonosexual cercariaeSchistosoma japonicumTh1/Th2gut microbiota
Identification of key genes and functional coexpression modules in ulcerative colitis by gene datasets analysis

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000164142 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

基因数据集分析鉴定溃疡性结肠炎关键基因与功能共表达模块

Data_Sheet_1_Monosexual Cercariae of Schistosoma japonicum Infection Protects Against DSS-Induced Colitis by Shifting the Th1/Th2 Balance and Modulating the Gut Microbiota.XLSX

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含 1 个 XLSX 文件,配套论文发表于 Infection and Immunity(2019)。源站描述围绕 DSS 诱导的 IBD 小鼠模型,比较感染单性日本血吸虫尾蚴与地塞米松阳性对照的保护效果,评估临床体征、组织病理学病变和肠道通透性,并检测 Th1/Th2 平衡与 Treg 细胞群体,同时涉及肠道菌群变化。数据可用于炎症性肠病与血吸虫感染免疫调节机制的研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Schistosoma mansoni Worm Infection Regulates the Intestinal Microbiota and Susceptibility to Colitis》发表于 Infection and Immunity(2019),DOI:10.1128/IAI.00275-19。源站首次发布:2021-01-05。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):炎症性肠病(IBD)相关炎症与结直肠癌的发生和进展密切相关。IBD 通常使用 5-氨基水杨酸和免疫调节药物治疗,但这些疗法的副作用和局限性日益显现。因此,开发新的预防或治疗方法势在必行。在本研究中,我们构建了葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的 IBD 小鼠模型,在第 1 天感染单性日本血吸虫尾蚴(mSjci),或从第 3 天至第 5 天给予地塞米松(DXM)作为阳性对照。通过评估临床体征、组织病理学病变和肠道通透性来评价 mSjci 对 IBD 小鼠的保护作用。为揭示潜在机制,还检测了 Th1/Th2 平衡和 Treg 细胞群体。此外,改变

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 164.14 KB。数据集 DOI:10.3389/fmicb.2020.606605.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。主题标签:inflammatory bowel disease、monosexual cercariae、Schistosoma japonicum、Th1/Th2、gut microbiota。本站分类:感染性疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Microbiology、Microbial Genetics、Microbial Ecology、Mycology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Monosexual_Cercariae_of_Schistosoma_japonicum_Infection_Protects_Against_DSS-Induced_Colitis_by_Shifting_the_Th1_Th2_Balance_and_Modulating_the_Gut_Microbiota_XLSX/13520192

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Zhou, Hongli; Zeng, Xiaojing; Sun, Dongchen; Chen, Zhe; Chen, Weixin; Fan, Liwei; et al. (2021). Data_Sheet_1_Monosexual Cercariae of Schistosoma japonicum Infection Protects Against DSS-Induced Colitis by Shifting the Th1/Th2 Balance and Modulating the Gut Microbiota.XLSX. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

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命令行下载

curl -L -o "Data_Sheet_1_Monosexual Cercariae of Schistosoma japonicum Infection Protects Against DSS-Induced Colitis by Shifting the Th1/Th2 Balance and Modulati.XLSX" "https://ndownloader.figshare.com/files/25951913"

文件清单

  • Data_Sheet_1_Monosexual Cercariae of Schistosoma japonicum Infection Protects Against DSS-Induced Colitis by Shifting the Th1/Th2 Balance and Modulati.XLSX(164.14 KB)

文件总体积 164.14 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

炎症性肠病(IBD)相关炎症与结直肠癌的发生和进展密切相关。IBD通常使用5-氨基水杨酸和免疫调节药物治疗,但这些疗法的副作用和局限性正逐渐显现。因此,开发新型预防或治疗方法势在必行。本研究构建了葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的IBD小鼠模型,于第1天感染单一性别的日本血吸虫尾蚴(mSjci),或于第3至5天给予地塞米松(DXM)作为阳性对照。通过评估临床体征、组织病理学病变和肠道通透性,评价了mSjci对IBD小鼠的保护作用。为揭示其潜在机制,还检测了Th1/Th2平衡和Treg细胞群体。此外,评估了肠道微生物群的变化,以探究mSjci调节的免疫反应与致病性微生物组之间的相互作用。与仅接受DSS处理的小鼠相比,接受DSS和mSjci处理的小鼠表现出更少的IBD临床体征和更轻的肠道通透性损伤。

在机制上,mSjci通过抑制IFN-γ产生、促进IL-10表达及增加Treg亚群数量来调节Th1/Th2平衡。此外,mSjci显著重塑了肠道微生物群落的结构、多样性和丰富度,进而发挥免疫调节作用。我们的研究结果表明,mSjci可能作为一种新型有效的保护策略,而肠道微生物群可能成为IBD的新治疗靶点。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fmicb.2020.606605.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Monosexual_Cercariae_of_Schistosoma_japonicum_Infection_Protects_Against_DSS-Induced_Colitis_by_Shifting_the_Th1_Th2_Balance_and_Modulating_the_Gut_Microbiota_XLSX/13520192)。

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