自闭症谱系障碍儿童与典型发育对照粪便微生物16S rRNA基因高通量测序数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.0142z

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集题为“孤独症谱系障碍儿童与典型发育对照儿童粪便微生物群16S rRNA基因高通量测序数据集”，由延安大学延安医学院基础医学院研究团队与延安大学附属医院儿科共同构建。共纳入51名孤独症谱系障碍（ASD）儿童和51名年龄、性别匹配的典型发育（TD）对照儿童。采集粪便样本，提取基因组DNA，对16S rRNA基因进行扩增并开展双端高通量测序。原始reads经去除接头和低质量reads的质量控制后生成clean data，并对所有文件计算MD5校验和以确保数据完整性。本数据集包含204个gzip压缩的FASTQ文件（*.fq.gz），包括51份ASD样本和51份TD样本，每份样本均含配对的read1/read2文件，总计约725 MB，另附一份MD5校验和列表（md5_list.csv）。

数据以gzip压缩的FASTQ格式存储，采用Phred+33质量编码，所有文件均按照“{group}{number}_{read}.fq.gz”的规则命名。该数据集为分析ASD中肠道微生物群落结构、多样性及潜在生物标志物提供了标准化的原始测序数据资源，并支持肠-脑轴机制研究、跨研究整合分析以及早期辅助诊断生物标志物的筛选。用户需同时引用本数据论文及数据集DOI。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。