自身诱导物-2依赖性群体感应对无症状菌尿大肠杆菌83972基因表达的影响

该数据集来自 NCBI GEO,研究自身诱导物-2(AI-2)依赖性群体感应对无症状菌尿大肠杆菌分离株 83972 转录水平基因表达的影响

geo
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基因组预测GPL21222562
GSE300954: Influence of the autoinducer-2 dependent quorum sensing on gene expression of asymptomatic bacteriuria E. coli isolate 83972

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

自身诱导物-2依赖性群体感应对无症状菌尿大肠杆菌83972基因表达的影响

Influence of the autoinducer-2 dependent quorum sensing on gene expression of asymptomatic bacteriuria E. coli isolate 83972

该数据集来自 NCBI GEO,研究自身诱导物-2(AI-2)依赖性群体感应对无症状菌尿大肠杆菌分离株 83972 转录水平基因表达的影响。数据包含野生型菌株与 lsr 互补变体 83972 attB::lsr 的 RNA-seq 分析结果,共 1 个文件(GSE300954_series_matrix.txt.gz)。可用于比较两组菌株的基因表达谱差异,识别受 AI-2 群体感应调控的转录本,为理解无症状菌尿大肠杆菌的群体感应调控机制提供数据基础(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 26 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为分析 AI-2 依赖性群体感应对大肠杆菌 83972 转录水平基因表达的影响,我们对野生型菌株和 lsr 互补变体 83972 attB::lsr 进行了 RNA-seq 分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21222、562。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300954

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。

下载信息

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为分析AI-2依赖性群体感应在大肠杆菌83972转录水平上对基因表达的影响,我们对野生型菌株和lsr互补变体83972 attB::lsr进行了RNA-seq分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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