三株蜡样芽孢杆菌在非条件与条件培养基中的转录组分析

该数据集来自 NCBI GEO,包含三株蜡样芽孢杆菌在非条件培养基与经 CaCo-2 细胞预孵育的条件培养基中的转录组 RNA 测序数据

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时间序列分类GPL262651396
GSE284237: Transcriptome analysis of three Bacillus cereus strains comparing non-conditioned growth medium (nk) with conditioned (k; pre-incubated with CaCo-2 cells), accomplished by RNA sequencing

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

三株蜡样芽孢杆菌在非条件与条件培养基中的转录组分析

Transcriptome analysis of three Bacillus cereus strains comparing non-conditioned growth medium (nk) with conditioned (k; pre-incubated with CaCo-2 cells), accomplished by RNA sequencing

该数据集来自 NCBI GEO,包含三株蜡样芽孢杆菌在非条件培养基与经 CaCo-2 细胞预孵育的条件培养基中的转录组 RNA 测序数据。研究涉及两株高毒力菌株 F837/76 = MHI 1505、NVH 0075-95 = MHI 3053 和一株低毒力菌株 RIVM BC90 = MHI 3178,旨在比较它们对模拟肠道环境的整体转录响应。数据可用于分析不同毒力菌株在宿主环境信号下的基因表达差异,为理解肠致病性蜡样芽孢杆菌的毒力调控提供基础(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肠致病性蜡样芽孢杆菌可引起表现为腹泻和腹痛的毒素感染。目前尚不完全清楚为何不同分离株在肠毒素产生和致病性上存在差异,以及宿主环境中的哪些信号触发毒性。本研究评估了三株先前已充分表征的菌株对模拟肠道环境的整体转录响应。研究了两株高毒力菌株 F837/76 = MHI 1505 和 NVH 0075-95 = MHI 3053,以及一株低毒力菌株 RIVM BC90 = MHI 3178。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL26265、1396。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE284237

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

致病性蜡样芽孢杆菌可引起中毒性感染,表现为腹泻和腹痛。目前尚不完全清楚为何不同分离株在肠毒素产生和致病性方面存在差异,以及哪些信号在宿主环境中触发毒性。本研究评估了三株先前已被充分表征的菌株对模拟肠道环境的整体转录反应。研究调查了两株高毒性菌株F837/76 = MHI 1505和NVH 0075-95 = MHI 3053,以及一株低毒性菌株RIVM BC90 = MHI 3178。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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