蜡样芽孢杆菌INRA C3铁缺乏及乳铁蛋白响应的转录组分析(RNA测序)

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE241250,对蜡样芽孢杆菌INRA C3在铁缺乏及乳铁蛋白处理下的转录组进行RNA测序分析

geo
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基因组分类GPL262651396
GSE241250: Transcriptome analysis of Bacillus cereus strain INRA C3 in response to iron depletion and lactoferrin, accomplished by RNA sequencing

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

蜡样芽孢杆菌INRA C3铁缺乏及乳铁蛋白响应的转录组分析(RNA测序)

Transcriptome analysis of Bacillus cereus strain INRA C3 in response to iron depletion and lactoferrin, accomplished by RNA sequencing

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE241250,对蜡样芽孢杆菌INRA C3在铁缺乏及乳铁蛋白处理下的转录组进行RNA测序分析。实验条件包括mMOD基本培养基、添加10 mg/ml乳铁蛋白的基本培养基以及无铁源的基本培养基。数据包含1个文件(GSE241250_series_matrix.txt.gz),可用于研究铁获取相关基因及肠毒素和毒力因子的差异调控,服务于感染性疾病领域的细菌响应机制探索(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):铁结合糖蛋白乳铁蛋白具有抗菌活性。为研究蜡样芽孢杆菌对乳铁蛋白的整体响应,进行了总转录组分析。生长条件为mMOD基本培养基、基本培养基加10 mg/ml乳铁蛋白,以及无铁源的基本培养基作为比较。特别关注参与铁获取的基因以及编码肠毒素和其他毒力因子的基因的差异调控。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL26265、1396。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241250

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 06 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

铁结合糖蛋白乳铁蛋白具有抗菌活性。为探究蜡样芽孢杆菌对乳铁蛋白的整体响应,进行了总转录组分析。生长条件包括mMOD基本培养基、添加10 mg/ml乳铁蛋白的基本培养基,以及作为对照的无铁源基本培养基。特别关注的是参与铁获取的基因以及编码肠毒素和其他毒力因子的基因的差异调控情况。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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