GSE253142：假耐药蜡样芽孢杆菌在琼脂扩散药敏试验中利用生物膜相关机制模拟万古霉素耐药

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE253142

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数据说明

糖肽类抗生素万古霉素是治疗由蜡样芽孢杆菌群成员引起的严重非胃肠道感染的首选药物。近年来，出现了零星检测到的万古霉素耐药表型，主要见于琼脂扩散试验中。食品包装分离株BC70在Etest和纸片扩散法中均表现出对万古霉素的假耐药表型。本研究利用纳米孔平台的RNA-Seq技术，研究了BC70细胞中的差异表达基因。这些细胞在使用Etest进行万古霉素药敏试验时能够主动移动进入抑菌圈，因而表现为耐药。转录组分析揭示，在假耐药细胞中，多个生物膜形成的关键基因（如calY、tasA、krsEABC）上调，提示存在一种与生物膜相关的运动机制。与群游细胞相比，毒力基因（如hblABCD、nheABC、plcR）和鞭毛基因的下调也证实了该假耐药分离株的非群游表型。这种与生物膜相关的运动类型不同于群游运动，被列入干扰可靠抗菌药物敏感性试验的细菌策略清单之中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。