人类疾病中的Z-DNA与Z-RNA数据
数据涉及左手螺旋 Z-DNA/Z-RNA 与 Zα 结构域蛋白家族(包括 ADAR、ZBP1 及病毒同源物)的高亲和力结合,覆盖 Aicardi-Goutières Syndrome、年龄相关性黄斑变性等与 Alu 介导相关的疾病,以及 ADAR 与 DICER1 在 RNA 中心性免疫向蛋白中心性

基本信息
资源简介
人类疾病中的Z-DNA与Z-RNA数据
Data from: Z-DNA and Z-RNA in human disease
该数据集来自 Dryad,由 Alan Herbert 于 2019 年发布,主题为人类疾病中的 Z-DNA 与 Z-RNA。数据涉及左手螺旋 Z-DNA/Z-RNA 与 Zα 结构域蛋白家族(包括 ADAR、ZBP1 及病毒同源物)的高亲和力结合,覆盖 Aicardi-Goutières Syndrome、年龄相关性黄斑变性等与 Alu 介导相关的疾病,以及 ADAR 与 DICER1 在 RNA 中心性免疫向蛋白中心性免疫转换中的调控作用。可用于研究 Z 构象位点与信号识别颗粒重叠对 Alu 逆转座子侵入灵长类基因组的限制,以及干扰素系统持续激活机制(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Un。
【数据集背景】
源站首次发布:2019。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):左手螺旋 Z-DNA/Z-RNA 被 Zα 结构域蛋白家族以高亲和力结合,该家族包括 ADAR(一种双链 RNA 编辑酶)、ZBP1 以及调控天然免疫的病毒同源物。ADAR p150 的功能丧失突变使 Alu dsRNA 持续激活干扰素系统,是 Aicardi-Goutières Syndrome 的致病原因。ADAR 与 DICER1 的异源二聚体调控从 RNA 中心性免疫向蛋白中心性免疫的转换。DICER1 功能丧失导致年龄相关性黄斑变性,这是一种不同类型的 Alu 介导疾病。Z 形成位点与信号识别颗粒位点的重叠很可能限制了 Alu 逆转座子对灵长类基因组的侵入。
【主题与分类】
主题标签:ZBP1、Signal Recognition Protein、Age Related Macular Degeneration、Alu、ADAR、DICER1、SRP14、Z-DNA、SRP9、Homo Sapiens。本站分类:感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.626tf4f
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.626tf4f
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- OpenDataLab:
数据集大小约 128.6 MB。
数据说明
左手螺旋Z-DNA/Z-RNA与Zα结构域蛋白家族具有高亲和力结合,该家族包括ADAR(一种双链RNA编辑酶)、ZBP1以及调节先天免疫的病毒同源蛋白。ADAR p150的功能丧失突变使得Alu双链RNA能够持续激活干扰素系统,并且是Aicardi-Goutières综合征的致病原因。ADAR与DICER1的异二聚体调控从以RNA为中心向以蛋白质为中心的免疫转换。DICER1功能丧失导致年龄相关性黄斑变性,这是一种不同类型的Alu介导疾病。Z形成位点与信号识别颗粒结合位点的重叠可能限制了Alu逆转录转座子对灵长类基因组的入侵。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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